Отдел молекулярных биосистем

Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН

127276 Москва, ул. Ботаническая 35

 Публикации (2000 – 2017)

Экспериментальные и обзорные статьи в журналах, патенты

Книги и главы в книгах

2017-2018


Стариков А.Ю., Усербаева А.А., Миронов К.С., Сидоров Р.А., Заядан Б.К., Бедбенов В.С., Синетова М.А., Лось Д.А. (2018) Субстратная специфичность ацил-липидной Δ9-десатуразы жирных кислот из цианобактерии Cyanobacterium sp. IPPAS B-1200 с необычным жирнокислотным составом. Физиология растений – в печати.

Allakhverdiev S.I., Zharmukhamedov S.K., Rodionova M.V., Shuvalov V.A., Dismukes C., Shen J.R., Barber J., Samuelsson G., Govindjee. (2017) Vyacheslav (Slava) Klimov (1945-2017): A scientist par excellence, a great human being, a friend, and a Renaissance man. Photosynth Res. - in press. https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11120-017-0440-5

Maksimov E.G., Sluchanko N.N., Slonimskiy Y.B., Mironov K.S., Klementiev K.E., Moldenhauer M., Friedrich T., Los D.A., Paschenko V.Z., Rubin A.B. (2017) The unique protein-to-protein carotenoid transfer mechanism. Biophys. J. 113 (2): 402–414.

Kreslavski V.D., Brestic M., Zharmukhamedov S.K., Lyubimov V.Y., Lankin A.V., Jajoo A., Allakhverdiev S.I. (2017) Mechanisms of inhibitory effects of polycyclic aromatic hydrocarbons in photosynthetic primary processes in pea leaves and thylakoid preparations. Plant Biol. (Stuttg). 19: 683-688. doi: 10.1111/plb.12598.

Rodionova M.V., Zharmukhamedov S.K., Karacan M.S., Venedik K.B., Shitov A.V., Tunç T., Mamaş S., Kreslavski V.D., Karacan N., Klimov V.V., Allakhverdiev S.I. (2017) Evaluation of new Cu(II) complexes as a novel class of inhibitors against plant carbonic anhydrase, glutathione reductase, and photosynthetic activity in photosystem II. Photosynth. Res.. 133(1-3): 139–153.doi: 10.1007/s11120-017-0392-9.

Tomo T., Allakhverdiev S.I. (2017) Preface: photosynthesis and hydrogen energy research for sustainability. Photosynth. Res. 133(1-3): 1–3. doi: 10.1007/s11120-017-0378-7.

Ivanov A.G., Velitchkova M.Y., Allakhverdiev S.I., Huner N.P. (2017) Heat stress-induced effects of photosystem I: an overview of structural and functional responses. Photosynth. Res. 133(1-3):17–30. doi: 10.1007/s11120-017-0383-x.

Salojärvi J., Smolander O.P., Nieminen K., Rajaraman S., Safronov O., Safdari P., Lamminmäki A., Immanen J., Lan T., Tanskanen J., Rastas P., Amiryousefi A., Jayaprakash B., Kammonen J., Hagqvist R., Eswaran G., Ahonen V.H., Serra J.A., Asiegbu F.O., de Dios Barajas-Lopez J., Blande D., Blokhina O., Blomster T., Broholm S., Brosché M., Cui F., Dardick C., Ehonen S.E., Elomaa P., Escamez S., Fagerstedt K.V., Fujii H., Gauthier A., Gollan P.J., Halimaa P., Heino P.I., Himanen K., Hollender C., Kangasjärvi S., Kauppinen L., Kelleher C.T., Kontunen-Soppela S., Koskinen J.P., Kovalchuk A., Kärenlampi S.O., Kärkönen A.K., Lim K.J., Leppälä J., Macpherson L., Mikola, J., Mouhu K., Mähönen A.P., Niinemets Ü., Oksanen E., Overmyer K., Palva E.T., Pazouki L., Pennanen V., Puhakainen T., Poczai P., Possen B.J.H.M., Punkkinen M., Rahikainen M.M., Rousi M., Ruonala R., van der Schoot C., Shapiguzov A., Sierla M., Sipilä T.P., Sutela S., Teeri T.H., Tervahauta A.I., Vaattovaara A., Vahala J., Vetchinnikova L., Welling A., Wrzaczek M., Xu E., Paulin L.G., Schulman A.H., Lascoux M., Albert V.A., Auvinen P., Helariutta Y., Kangasjärvi J. (2017) Genome sequencing and population genomic analyses provide insights into the adaptive landscape of silver birch. Nat. Genet. 49(6): 904–912.

Novikova G.V., Mur L.A.J., Nosov A.V., Fomenkov A.A., Mironov K.S., Mamaeva A.S., Shilov E.S., Rakitin V.Y., Hall M.A. (2017) Nitric oxide has a concentration-dependent effect on the cell cycle acting via EIN2 in Arabidopsis thaliana cultured cells. Front. Physiol. 8: 142.

Zivcak M., Brückova K., Sytar O., Brestic M., Olsovska K., Allakhverdiev S.I. (2017) Lettuce flavonoids screening and phenotyping by chlorophyll fluorescence excitation ratio. Planta 245(6):1215–1229.

Khudyakova A.Y., Kreslavski V.D., Shirshikova G.N., Zharmukhamedov S.K., Kosobryukhov A.A., Allakhverdiev S.I. (2017) Resistance of Arabidopsis thaliana L. photosynthetic apparatus to UV-B is reduced by deficit of phytochromes B and A. J. Photochem. Photobiol. B. Biol. 169: 41-46.

Miyachi M., Ikehira S., Nishiori D., Yamanoi Y., Yamada M., Iwai M., Tomo T., Allakhverdiev S.I., Nishihara H. (2017) Photocurrent Generation of Reconstituted Photosystem II on a Self-Assembled Gold Film. Langmuir 33(6): 1351-1358.

Najafpour M.M., Heidari S., Balaghi S.E., Hołyńska M., Sadr M.H., Soltani B., Khatamian M., Larkum A.W., Allakhverdiev S.I. (2017) Proposed mechanisms for water oxidation by Photosystem II and nanosized manganese oxides. Biochim. Biophys. Acta. 1858(2): 156-174.

Tsygankov A.A., Allakhverdiev S.I., Tomo T., Govindjee. (2017) International conference on "Photosynthesis Research for Sustainability-2016": In honor of Nathan Nelson and Turhan Nejat Veziroğlu. Photosynth Res. 131(2): 227-236.

Sinetova M.A., Bolakhan K., Sidorov R.A., Mironov K.S., Skrypnik A.N., Kupriyanova E.V., Zayadan B.K., Shumskaya M.A., Los D.A. (2017) Polyphasic characterization of the thermotolerant cyanobacterium Desertifilum sp. strain IPPAS B-1220. FEMS Microbiol. Lett. 364(4): fnx027.

Maksimov E.G., Mironov K.S., Trofimova M.S., Nechaeva N.L., Todorenko D.A., Klementiev K.E., Tsoraev G.V., Tyutyaev E.V., Zorina A.A., Feduraev P.V., Allakhverdiev S.I., Paschenko V.Z., Los D.A. (2017) Membrane fluidity controls redox-regulated cold stress responses in cyanobacteria. Photosynth. Res. 133(1), 215-223. doi: 10.1007/s11120-017-0337-3

Maksimov E.G., Sluchanko N.N., Mironov K.S., Shirshin E.A., Klementiev K.E., Tsoraev G.V., Moldenhauer M., Friedrich T., Los D.A., Allakhverdiev S.I., Paschenko V.Z., Rubin A.B. (2017) Fluorescent labeling preserving OCP photoactivity reveals its reorganization during the photocycle. Biophys. J. 112(1): 46-56.

Kupriyanova E.V., Pronina N.A., Los D.A. (2017) Carbonic anhydrase – a universal enzyme of the carbon-based life. Photosynthetica 55 (1): 3-19.

Zayadan B.K., Sadvakasova A.K., Usserbayevaa A.A., Bolatkhan K., Baizhigitova A.M., Akmukhanova N.R., Sidorov R.A., Sinetova M.A., Los D.A. (2017) Waste-free technology of wastewater treatment to obtain microalgal biomass for oil production. Intl. J. Hydrogen Energ. – in press.

Voloshin R.A., Bedbenov V.S., Gabrielyan D.A., Brady N.G., Kreslavski V.D. , Zharmukhamedov S.K., Rodionova M.V., Bruce B.D., Allakhverdiev S.I. (2017) Optimization and characterization of TiO2-based solar cell design using diverse plant pigments. Intl. J. Hydrogen Energy – in press.

Rodionova M.V., Poudyal R.S., Tiwari I., Voloshin R.A., Zharmukhamedov S.K., Nam H.G., Zayadan B.K., Bruce B.D., Hou H.J.M., Allakhverdiev S.I. (2017) Biofuel production: Challenges and opportunities. Intl. J. Hydrogen Energy – in press.

Najafpour M.M., Heidari S., Balaghi S.E., Hołyńska M., Sadr M.H., Soltani B., Khatamian M., Larkum A.W., Allakhverdiev S.I. (2017) Proposed mechanisms for water oxidation by Photosystem II and nanosized manganese oxides. Biochim. Biophys Acta 1858(2): 156-174.

Мамаева А.С., Фоменков А.А., Носов А.В., Новикова Г.В. (2017) Регуляция оксидом азота фосфорилирования белков в культуре клеток Arabidopsis thaliana. Физиология растений – в печати.

Обручева Н.В., Синькевич И.А., Литягина С.В., Новикова Г.В. (2017) Особенности водного режима при прорастании семян. Физиология растений – в печати.

Стариков А.Ю., Усербаева А.А., Лапина С.С., Миронов К.С., Маслова И.П., Пчёлкин В.П., Заядан Б.К., Синетова М.А., Лось Д.А. (2017) Субстратная специфичность ацил-липидной ∆9-десатуразы из цианобактерии Prochlorothrix hollandica – продуцента миристолеиновой кислоты. Физиология растений – в печати.

2016


Tsygankov A.A., Allakhverdiev S.I., Tomo T., Govindjee (2016) International conference on "Photosynthesis Research for Sustainability-2016" : In honor of Nathan Nelson and Turhan Nejat Veziroğlu. Photosynth. Res. 131(2): 227-236. doi: 10.1007/s11120-016-0311-5

Kreslavski V.D., Kosobryukhov A.A., Schmitt F.J., Semenova G.A., Shirshikova G.N., Khudyakova A.Y., Allakhverdiev S.I. (2016) Photochemical activity and the structure of chloroplasts in Arabidopsis thaliana L. mutants deficient in phytochrome A and B. Protoplasma - in press. doi: 10.1007/s00709-016-1020-9

Mironov K.S., Sinetova M.A., Bolatkhan K., Zayadan B.K., Ustinova V., Kupriyanova E.V., Skrypnik A.N., Gogoleva N.E., Gogolev Y.V., Los D.A. (2016) Draft genome sequence of the thermotolerant cyanobacterium Desertifilum sp. IPPAS B-1220. Genome Announc. 4(6):e01304-16. doi: 10.1128/genomeA.01304-16

Starikov A.Y., Usserbaeva A., Sinetova M.A., Sarsekeyeva F.K., Zayadan B.K., Ustinova V., Kupriyanova E.V., Los D.A., Mironov K.S. (2016) Draft genome sequence of Cyanobacterium sp. strain IPPAS B-1200 with unique fatty acid composition. Genome Announc. 4(6):e01306-16. doi: 10.1128/genomeA.01306-16

Sinetova M.A., Los D.A. (2016) Systemic analysis of transcriptomics of Synechocystis: common stress genes and their universal triggers. Molecular BioSystems 12: 3254-3258.

Sinetova M.A., Los D.A. (2016) New insights in cyanobacterial cold stress responses: Genes, sensors, and molecular triggers. Biochim. Biophys. Acta, General Subjects. 1860 (11, Part A): 2391–2403.

Allakhverdiev S.I., Kreslavski V.D., Zharmukhamedov S.K., Voloshin R.A., Korol'kova D.V., Tomo T., Shen J.R. (2016) Chlorophylls d and f and their role in primary photosynthetic processes of cyanobacteria. Biochemistry (Mosc). 81(3): 201-112.

Kerchev P.I., Waszczak C., Lewandowska A., Willems P., Shapiguzov A., Li Z., Alseekh S., Mühlenbock P., Hoebrichts F., Huang J.J., Van Der Kelen K., Kangasjärvi J., Fernie A.R., De Smet R., Van de Peer Y., Messens J., Van Breusegem F. (2016) Lack of GLYCOLATE OXIDASE 1, but not GLYCOLATE OXIDASE 2, attenuates the photorespiratory phenotype of CATALASE2-deficient Arabidopsis. Plant Physiol. 171: 1704–1719. doi: 10.1104/pp.16.00359

Vainonen J.P., Shapiguzov A., Vaattovaara A., Kangasjärvi J. (2016) Plant PARPs, PARGs and PARP-like Proteins. Curr. Prot. Pept. Sci. 17(7): 713-723.

Najafpour M.M., Salimi S., Madadkhani S., Hołyńska M., Tomo T., Allakhverdiev S.I. (2016) Nanostructured manganese oxide on silica aerogel: a new catalyst toward water oxidation. Photosynth. Res. 130(1): 225–235. doi: 10.1007/s11120-016-0247-9

Brestic M., Zivcak M., Kunderlikova K., Allakhverdiev S.I. (2016) High temperature specifically affects the photoprotective responses of chlorophyll b-deficient wheat mutant lines. Photosynth. Res. 130(1): 251–266. doi:10.1007/s11120-016-0249-7

Huseynova I.M., Allakhverdiev S.I., Govindjee (2016) Jalal A. Aliyev (1928-2016): a great scientist, a great teacher and a great human being. Photosynth. Res. 128(3): 219–222. doi: 10.1007/s11120-016-0242-1

Karacan M.S., Rodionova M.V., Tunç T., Venedik K.B., Mamaş S., Shitov A.V., Zharmukhamedov S.K., Klimov V.V., Karacan N., Allakhverdiev S.I. (2016) Characterization of nineteen antimony(III) complexes as potent inhibitors of photosystem II, carbonic anhydrase, and glutathione reductase. Photosynth. Res. 130(1): 167–182. doi: 10.1007/s11120-016-0236-z

Shapiguzov A., Chai X., Fucile G., Longoni P., Zhang L., Rochaix J.-D. (2016) Activation of the Stt7/STN7 kinase through dynamic interactions with the cytochrome b6f complex. Plant Physiol. 171: 82–92. doi:10.1104/pp.15.01893

Синетова М.А., Лось Д.А. (2016) Уроки транскриптомики цианобактерий: универсальные гены и триггеры стрессовых ответов. Молекулярная биология 50(4): 685–694.

Kupriyanova E.V., Cho S.M., Park Y.-I., Pronina N.A., Los D.A. (2016) The complete genome of a cyanobacterium from a soda lake reveals the presence of the components of CO2-concentrating mechanism. Photosynth. Res. 130(1): 151-165. doi: 10.1007/s11120-016-0235-0

Najafpour M.M., Renger G., Hołyńska M., Moghaddam A.N., Aro E.M., Carpentier R., Nishihara H., Eaton-Rye J.J., Shen J.R., Allakhverdiev S.I. (2016) Manganese compounds as water-oxidizing catalysts: From the natural water-oxidizing complex to nanosized manganese oxide structures. Chem. Rev. 116(5): 2886–2936. doi: 0.1021/acs.chemrev.5b00340

Лапина С.С., Маслова И.П., Пчёлкин В.П., Бедбенов В.С., Миронов К.С., Заядан Б.К., Усербаева А.А., Синетова M.A., Лось Д.А. (2016) Оптимизация условий культивирования цианобактерии Prochlorothrix hollandica для получения миристолеиновой кислоты. Физиология растений 63(4): 593–600.

Zorina A., Sinetova M., Kupriyanova E.V., Mironov K.S., Molkova I., Nazarenko L.V., Zinchenko V.V., Los D.A. (2016) Synechocystis mutants defective in manganese uptake regulatory system, ManSR, are hypersensitive to strong light. Photosynth. Res. 130(1): 11-17. doi: 10.1007/s11120-015-0214-x  


2015

Cho S.M., Jeoung S.C., Song J.-Y., Kupriyanova E.V., Pronina N.A., Lee B.-W., Jo S.-W., Park B.-S., Choi S.B., Song J.-J., Park Y.-I. (2015) Genomic survey and biochemical analysis of recombinant candidate cyanobacteriochromes reveals enrichment for near UV/Violet sensors in the halotolerant and alkaliphilic cyanobacterium Microcoleus IPPAS B353. J. Biol. Chem. 290: 28502–28514. doi: 10.1074/jbc.M115.669150

Sinetova M.A., Mironov K.S., Mustardy L., Shapiguzov A., Bachin D., Allakhverdiev S.I., Los D.A. (2015) Aquaporin-deficient mutant of Synechocystis is sensitive to salt and high-light stress. J. Photochem. Photobiol. B. Biol. 152: 377–382. doi: 10.1016/j.jphotobiol.2015.07.012

Zivcak M., Brestic M., Kunderlikova K., Olsovska K., Allakhverdiev S.I. (2015) Effect of photosystem I inactivation on chlorophyll a fluorescence induction in wheat leaves: Does activity of photosystem I play any role in OJIP rise? Photochem. Photobiol. B. Biology 152 (Part B): 318-324. doi: 10.1016/j.jphotobiol.2015.08.024

Ivanov A.G., Morgan-Kiss R.M., Krol M., Allakhverdiev S.I., Zanev Y., Sane P.V., Huner N.P. (2015) Photoinhibition of photosystem I in a pea mutant with altered LHCII organization. J. Photochem. Photobiol.  B. Biology 152 (Part B): 335-346. doi: 10.1016/j.jphotobiol.2015.08.018.

Bachin D., Nazarenko L.V.,Mironov K.S., Pisareva T., Allakhverdiev S.I., Los D.A. (2015) Mechanosensitive ion channel MscL controls ionic fluxes during cold and heat stress in Synechocystis. FEMS Microbiol. Lett. - in press. doi: 10.1093/femsle/fnv090

Sarsekeyeva F., Zayadan B.K., Usserbaeva A., Bedbenov V.S., Sinetova M.A., Los D.A. (2015) Cyanofuels – biofuels from cyanobacteria: reality and perspectivesPhotosynth. Res. 125: 329-340. doi: 10.1007/s11120-015-0103-3

Allakhverdiev S.I., Ramakrishna S. (2015) A random walk to and through the photoelectrochemical cells based on photosynthetic systems. Biofuel Res. J. 6: 222

Voloshin R.A., Kreslavski V.D., Zharmukhamedov S.K., Bedbenov V.S., Ramakrishna S., Allakhverdiev S.I. (2015) Photoelectrochemical cells based on photosynthetic systems: a review. Biofuel Res. J. 6: 227–235.

Nath K., Najafpour M.M., Voloshin R.A., Balaghi S.E., Tyystjärvi E., Timilsina R., Eaton-Rye J.J., Tomo T., Nam H.G., Nishihara H., Ramakrishna S., Shen J.R., Allakhverdiev S.I. (2015) Photobiological hydrogen production and artificial photosynthesis for clean energy: from bio to nanotechnologies. Photosynth Res. 126(2): 237-247. doi: 10.1007/s11120-015-0139-4

Najafpour M.M., Fekete M., Sedigh D.J., Aro E.M., Carpentier R., Eaton-Rye J.J., Nishihara H., Shen J.R., Allakhverdiev S.I., Spiccia L. (2015) Damage management in water-oidizing catalysts: from photosystem II to nanosized metal oxides. ACS Catalysis 5: 1499−1512.

Najafpour M.M., Ghobadi M.Z., Larkum A.W., Shen J.R., Allakhverdiev S.I. (2015) The biological water-oxidizing complex at the nano-bio interface. Trends Plant Sci. 20(9): 559-568. doi: 10.1016/j.tplants.2015.06.005

Najafpour M.M., Ghobadi M.Z., Haghighi B., Tomo T., Shen J., Allakhverdiev S.I. (2015) Comparison of nano-sized Mn oxides with the Mn cluster of photosystem II as catalysts for water oxidationBiochim. Biophys. Acta 1847(2): 294-306. doi: 10.1016/j.bbabio.2014.11.006

Najafpour M.M., Hosseini S.M., Hołynska M., Tomo T., Allakhverdiev S.I. (2015) Gold nanorods or nanoparticles deposited on layered manganese oxide: new findings. New J. Chem. 39: 7260–7267.

Najafpour M.M., Hosseini S.M., Hołyńska M., Tomo T., Allakhverdiev S.I. (2015) Manganese oxides supported on gold nanoparticles: new findings and current controversies for the role of gold. PhotosynthRes. 126: 477-487. doi: 10.1007/s11120-015-0164-3

Najafpour M.M., Hosseini S.M., Holynska M., Tomo T.,Allakhverdiev S.I. (2015) Platinum/manganese oxide nanocomposites as water-oxidizing catalysts: New findings and current controversies. Inter. J. Hydrogen Energy 40: 10825–10832.

Najafpour M.M., Allakhverdiev S.I. (2015) Nano-sized Mn oxide: A true catalyst in the water-oxidation reactionJ. Photochem. Photobio.l B. Biol. 126 (Part A): 477-487. doi: 10.1016/j.jphotobiol.2015.01.014

Najafpour M.M., Allakhverdiev S.I. (2015)Recent progress in the studies of structure and function of Photosystem I and II. J. Photochem. Photobiol. B. 152 (Part B) 173-175. 

Najafpour M.M., Carpentier R., Allakhverdiev S.I. (2015) Artificial photosynthesis. J. Photochem. Photobiol. B. Biol. 152 (Part A): 1-3.  

Najafpour M.M., Isaloo M.A., Hołyńska M., Shen J.R., Allakhverdiev S.I. (2015) The effect of lanthanum (III) and cerium (III) ions between layers of manganese oxide on water oxidation. Photosynth. Res. 126: 489–498.

Zavřel T., Sinetova M.A., Červený J. (2015) Measurement of chlorophyll a and carotenoid concentration in cyanobacteria. Bio-protocol 5(9): e1467. http://www.bio-protocol.org/e1467

Kurepin L.V., Ivanov A.G., Zaman M., Pharis R.P., Allakhverdiev S.I., Hurry V., Hüner N.P. (2015) Stress-related hormones and glycinebetaine interplay in protection of photosynthesis under abiotic stress conditions. Photosynth. Res126(2): 221-235. doi: 10.1007/s11120-015-0125-x

Zivcak M., Brestic M., Kunderlikova K., Sytar O., Allakhverdiev S.I. (2015) Repetitive light pulse-induced photoinhibition of photosystem I severely affects CO2 assimilation and photoprotection in wheat leaves. Photosynth. Res.  126(2): 449-463. doi: 10.1007/s11120-015-0121-1

Brestic M., Zivcak M., Kunderlikova K., Sytar O., Shao H., Kalaji H.M., Allakhverdiev S.I. (2015) Low PSI content limits the photoprotection of PSI and PSII in early growth stages of chlorophyll b-deficient wheat mutant lines. Photosynth. Res. 125(1): 151166. doi: 10.1007/s11120-015-0093-1

Мамаева А.С.Фоменков А.A., Носов А.В., Мошков И.Е., Мур Л.А.Дж., Холл М.А., Новикова Г.В. (2015) Регуляторная роль оксида азота у растений. Физиология растений 62(4): 459-473.

Фоменков А.А., Носов А.В., Ракитин В.Ю., Суханова Е.С., Мамаева А.С., Соболькова Г.И., Носов А.М., Новикова Г.В. (2015) Этилен сопровождает пролиферацию культивируемых клеток растений или участвует в ее регуляции? Физиология растений 62: 839–846.

Куприянова Е.В., Самылина О.С. (2015) СО2-концентрирующий механизм и его особенности у галоалкалофильных цианобактерийМикробиология 84(2): 144-159.

Carpentier R., Allakhverdiev S.I. (2015) In honor of Vladimir A. Shuvalov: light energy conversion in photosynthesis. Photosynth. Res. 125(1): 1-3. doi: 10.1007/s11120-015-0108-y

Brestic M., Zivcak M., Kunderlikova K., Sytar O., Shao H., Kalaji H.M., Allakhverdiev S.I. (2015) Low PSI content limits the photoprotection of PSI and PSII in early growth stages of chlorophyll b-deficient wheat mutant lines. Photosynth. Res. 125(1): 151-166. 2015 doi: 10.1007/s11120-015-0093-1

Akimoto S., Shinoda T., Chen M., Allakhverdiev S.I., Tomo T. (2015) Energy transfer in the chlorophyll f-containing cyanobacterium, Halomicronema hongdechloris, analyzed by time-resolved fluorescence spectroscopies. Photosynth. Res. 125(1): 115-122. doi: 10.1007/s11120-015-0091-3

Zorina A.A., Novikova G.V., Los D.A. (2015) Substrate specificity of recombinant Ser/Thr protein kinase. Bio-protocol 5(6): e1426. http://www.bio-protocol.org/e1426

Mironov K.S., Los D.A. (2015) RNA isolation from SynechocystisBio-protocol 5(6): e1428. http://www.bio-protocol.org/e1428

Červený J., Sinetova M.A., Zavřel T., Los D.A. (2015) Mechanisms of high temperature resistance of Synechocystis sp. PCC 6803: an impact of histidine kinase 34. Life 5(1): 676-699. doi: 10.3390/life5010676

Los D.A., Mironov K.S. (2015) Modes of fatty acid desaturation in cyanobacteria: an update. Life 5: 554-567. doi: 10.3390/life5010554

Zavřel T., Sinetova M.A., Búzová D., Literáková P., Červený J. (2015) Characterization of a model cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 autotrophic growth in a flat-panel photobioreactorEngineering in Life Sciences 1: 122-132. doi: 10.1002/elsc.201300165

 

2014

Bosa K., Jadczuk-Tobjasz E., Kalaji M.H., Majewska M., Allakhverdiev S.I. (2014) Evaluating the effect of rootstocks and potassium level on photosynthetic productivity and yield of pear trees. Russian J Plant Physiol. 61(2): 231–237.

Borawska-Jarmuowicz B., Mastalerczuk G., Kalaji H.M., Carpentier R., Pietkiewicz S., Allakhverdiev S.I. (2014) Photosynthetic efficiency and survival of Dactylis glomerata and Lolium perenne following low temperature stress. Russian J. Plant Physiol. 61(3): 281-288.

Hall M.A., Moshkov I., Novikova G., Hebelstrup K., Mandon J., Cristescu S., Harren F., Mur L.A.J. (2014) Interactions between nitric oxide and ethylene in monomeric G-protein activation in relation to food spoilage. Genetics Plant Physiol. 4 (1-2): 3-12.

Wiechen M., Najafpour M.M., Allakhverdiev S.I., Spiccia L. (2014) Water oxidation catalysis by manganese oxides: learning from evolution. Energy & Environmental Sciences 7: 2203-2212.

Kumar P.S., Sundaramurthy J., Sundarrajan S., Babu V.J., Singh G., Allakhverdiev S.I., Ramakrishna S. (2014) Hierarchical electrospun nanofibers for energy harvesting, production and environmental remediation. Energy & Environmental Sciences 7:3192-3222. 

Dubrovina A.S., Aleynova O.A., Kiselev K.V., Novikova G.V. (2014) True and false alternative transcripts of calcium-dependent protein kinase CPK9 and CPK3a genes in Vitis amurensis. Acta Physiol. Plant. 36(7): 1727-1737. doi: 10.1007/s11738-014-1547-3.

Novikova G.V., Tournaire-Roux C., Sinkevich I.A., Lityagina S.V., Maurel C., Obroucheva N. (2014) Vacuolar biogenesis and aquaporin expression at early germination of broad bean seeds. Plant Physiol. Biochem. 82: 123-132.

Носов А.В., Фоменков А.А., Мамаева А.С., Соловченко А.Е., Новикова Г.В. (2014) Дополнительные возможности использования клик-реакции 5-этинил-2’-дезоксиуридина с азидами флюорохромов в изучении клеточного цикла и метаболизма дезоксирибонуклеозидов.Физиология растений 61(6): 893-904.

Фоменков А.А., Носов А.В., Ракитин В.Ю., Мамаева А.С., Новикова Г.В. (2014) Цитофизиологические особенности культивируемых клеток Arabidopsis thaliana с нарушенным восприятием сигнала этилена рецептором ETR1. Физиология растений 61(5): 640-650. 

Шевченко Г.В., Каравайко Н.Н., Селиванкина С.Ю., Зубкова Н.К., Куприянова Е.В., Лось Д.А., Кузнецов В.В., Кулаева О.Н. (2014) Возможное участие цианобактерий в формировании гормональной системы растений. Физиология растений 61(2): 170-176.

Sarsekeyeva F.K., Usserbaeva A.A., Zayadan B.K., Mironov K.S., Sidorov R.A., Kozlova A. Yu., Kupriyanova E.V., Sinetova M.A., Los D.A. (2014) Isolation and characterization of a new cyanobacterial strain with a unique fatty acid compositionAdvances in Microbiology – 4: 1033-1043. doi: 10.4236/aim.2014.415114

Mironov K.S., Sidorov R.A., Kreslavski V.D., Bedbenov V.S., Tsydendambaev V.D., Los D.A. (2014) Cold-induced gene expression and omega-3 fatty acid unsaturation is controlled by red light in SynechocystisJ. Photochem. Photobiol. B: Biol. 137: 84-88.  

Allakhverdiev S.I., Aro E.-M., Tomo T. (2014) Special issue on Photosynthesis Research for Sustainability. Plant Physiol Biochem. 81: 1-2.

Allakhverdiev S.I., Shen J.-R. (2014) Photosynthesis research for sustainability: Keys to produce clean energy. Biochim. Biophys. Acta (BBA-Bioenergetics) 1837: 1377-1383.

Tomo T, Govindjee. (2014) International conference on "Photosynthesis research for sustainability-2014: in honor of Vladimir A. Shuvalov", held on June 2-7, 2014, in Pushchino, Russia. Photosynth Res. 122 (3): 337-347.  

Hou H.J.M., Allakhverdiev S.I., Najafpour M.M., Govindjee (2014) Current challenges in photosynthesis: from natural to artificial. (Editorial/Introduction) Front. Plant Sci. 5: 232. doi: 10.3389/fpls.2014.00232.

Kalaji H.M., Oukarroum A., Alexandrov V., Kouzmanova M., Brestic M., Zivcak M., Samborska I.A., Cetner M.D., Allakhverdiev S.I., Goltsev V. (2014) Identification of nutrient deficiency in maize and tomato plants by in vivo chlorophyll a fluorescence measurements. Plant Physiol. Biochem. - 81: 16-25.

Kalaji H.M., Schansker G., Ladle R.J., Goltsev V., Bosa K., Allakhverdiev S.I., Brestic M., Bussotti F., Calatayud A., Dąbrowski P., Elsheery N.I., Ferroni L., Guidi L., Hogewoning S.W., Jajoo A., Misra A.N., Nebauer S.G., Pancaldi S., Penella C., Poli D., Pollastrini M., Romanowska-Duda Z.B., Rutkowska B., Serôdio J., Suresh K., Szulc W., Tambussi E., Yanniccari M., Zivcak M. (2014) Frequently asked questions about in vivo chlorophyll fluorescence: practical issues. Photosynth. Res. 122(2): 121-58.

Najafpour M.M., Ghobadi M.Z., Haghighi B., Eaton-Rye J.J., Tomo T., Shen J.R., Allakhverdiev S.I. (2014) Nano-Sized Manganese-Calcium Cluster in Photosystem II. Biochemistry (Mosc). 79(4): 324-36. 

Najafpour M.M., Abasi M., Tomo T., Allakhverdiev S.I. (2014) Nanolayered manganese oxide/C60 composite: a good water-oxidizing catalyst for artificial photosynthetic systems. Dalton Trans. 43: 12058-12064.

Najafpour M.M., Abasi M., Tomo T., Allakhverdiev S.I. (2014) Mn oxide/nanodiamond composite: A new water-oxidizing catalyst for water oxidation. RSC Advances 4: 37613-37619.

Najafpour M.M., Ghobadi M.Z., Haghighi B., Eaton-Rye J.J., Tomo T., Shen J.R., Allakhverdiev SI. (2014) Nano-Sized Manganese-Calcium Cluster in Photosystem II. Biochemistry (Mosc). 79(4): 324-36. 

Najafpour M.M., Heidari S., Amini E., Khatamian M., Carpentier R., Allakhverdiev S.I. (2014) Nano-sized layered Mn oxides as promising and biomimetic water oxidizing catalysts for water splitting in artificial photosynthetic systems. J. Photochem. Photobiol. B. Biol. 5 (133): 124-139.

Najafpour M.M., Isaloo M.A., Eaton-Rye J.J., Tomo T., Nishihara H., Satoh K., Carpentier R., Shen J.R., Allakhverdiev S.I. (2014) Water exchange in manganese-based water-oxidizing catalysts in photosynthetic systems: From the water-oxidizing complex in photosystem II to nano-sized manganese oxides. Biochim. Biophys. Acta 1837: 1395-1410.

Najafpour M.M., Rahimi F., Fathollahzadeh M., Haghighi B., Hołyńska M., Tomo T., Allakhverdiev SI. (2014) Nanostructured manganese oxide/carbon nanotubes, graphene and graphene oxide as water-oxidizing composites in artificial photosynthesis. Dalton Trans. 43(28): 10866-10876. 

Najafpour M.M., Ghobadi M.Z., Haghighi B., Tomo T., Carpentier R., Shen J.R., Allakhverdiev S.I. (2014) A nano-sized manganese oxide in a protein matrix as a natural water-oxidizing sitePlant Physiol. Biochem. 81: 3-15. 

Tomo T., Shinoda T., Chen M., Allakhverdiev S.I., Akimoto S. (2014) Energy transfer processes in chlorophyll f-containing cyanobacteria using time-resolved fluorescence spectroscopy on intact cells. Biochim. Biophys. Acta. 2014 1837: 1484-1489. 

Юрьева Н.О., Кирсанова С.Н., Соболькова Г.И., Деревягина М.К., Голденкова-Павлова И.В., Шимшилашвили Х.Р., Лось Д.А. (2014) Способ получения форм картофеля сорта скороплодный in vitro, устойчивых к температурным стрессам и к возбудителю фитофтороза. Патент РФ № 2505955 от 20 февраля 2014 г. по Заявке № 2012119380.

Kreslavski V.D., Lankin A.V., Vasilyeva G.K., Luybimov V.Yu., Semenova G.N.,  Schmitt F.-J., Friedrich T., Allakhverdiev S.I. (2014) Effects of polyaromatic hydrocarbons on photosystem II activity in pea leaves. Plant Physiol. Biochem. 81: 135-142. 

Brestic M., Zivcak M., Olsovska K., Shao H.B., Kalaji H.M., Allakhverdiev S.I. (2014) Reduced glutamine synthase activity plays a role in control of photosynthetic responses to high light in barley leavesPlant Physiol. Biochem. 81: 74-83.

Ланкин А.В., Креславский В.Д., Худякова А.Ю., Жармухамедов С.К., Аллахвердиев С.И. (2014) Влияние нафталина на фотохимическую активность фотосистемы 2 гороха. Биохимия 79: 1493-1504.

Schmitt F.-J., Renger G., Friedrich T., Kreslavski V.D., Zharmukhamedov S.K., Los D.A., Kuznetsov Vl.V., Allakhverdiev S.I. (2014) Reactive oxygen species: re-evaluation of generation, monitoring and role in stress-signaling in phototrophic organisms. Biochim. Biophys. Acta 1837: 835-848.

Зорина А.А., Бедбенов В.С., Новикова Г.В., Паничкин В.Б., Лось Д.А. (2014) Участие серин-треониновых протеинкиназ в ответах на холодовой стресс у цианобактерии Synechocystis sp. PCC 6803: функциональная характеристика SpkE. Молекулярная биология 48(3): 452-462.

Vullo D., Kupriyanova E.V., Scozzafava A., Capassoc C., Supuran C.T. (2014) Anion inhibition study of the β-carbonic anhydrase (CahB1) from the cyanobacterium Coleofasciculus chthonoplastes (ex-Microcoleus chthonoplastes)Bioorganic & Medicinal Chemistry 22(5): 1667-1671.

Karacan M.S., Zharmukhamedov S.K., Mamas S., Kupriyanova E.V., Shitov A., Klimov V., Özbek N., Özmen Ü., Gündüzalp A., Schmitt F.-J., Karacan N., Friedrich T., Los D.A.. Carpentier R., Allakhverdiev S.I. (2014) Screening of novel chemical compounds as possible inhibitors of carbonic anhydrase and photosynthetic activity of photosystem II. J. Photochem. Photobiol. B: Biol. 137: 156-167.


2013

Nguyen L.T.H., Chen S., Elumalai N.K., Prabhakaran M.P., Zong Y., Vijila C., Allakhverdiev S.I., Ramakrishna S. (2013) Biological, chemical, and electronic applications of nanofibers. Macromolecular Materials and Engineering 298: 822–867.

Zharmukhamedov S.K., Allakhverdiev S.I., Smolova T.N., Klimov V.V. (2013) Bicarbonate stimulates the electron donation from Mn2+ to P680+ in isolated D1/D2/cytochrome b559 complex. J. Photochem. Photobiol. B. Biol. 129C: 87-92. doi: 10.1016/j.jphotobiol.2013.10.001.

Allakhverdiev S.I., Shen J.R., Edwards G.E. (2013) Special issues on Photosynthesis Education honoring GovindjeePhotosynth. Res. 116(2-3): 107-110. doi: 10.1007/s11120-013-9913-3.

Allakhverdiev S.I., Huseynova I.M., Govindjee (2013) International conference on "Photosynthesis research for sustainability-2013: in honor of Jalal A. Aliyev", held during June 5-9, 2013, Baku,  Azerbaijan. Photosynth Res. 2013 118(3): 297-307. doi: 10.1007/s11120-013-9901-7.

Kreslavski V.D., Shirshikova G.N., Lyubimov V.Y., Shmarev A.N., Boutanaev A.M., Kosobryukhov A.A., Schmitt F.J., Friedrich T., Allakhverdiev S.I. (2013) Effect of preillumination with red light on photosynthetic parameters and oxidant-/antioxidant balance in Arabidopsis thaliana in response to UV-A. J. Photochem. Photobiol. B. Biol. 127C: 229-236. doi: 10.1016/j.jphotobiol.2013.08.008

Pchelkin V.P., Los D.A. (2013) Quality control criteria for liquid chromatographic separation of membrane lipids with nanoscale silver clusters. SOAJ  NanoPhotoBioSciences. 1: 119-145.

Schmitt F.-J., Maksimov E., Junghans C., Weißenborn J., Hätti P., Paschenko V.Z., Allakhverdiev S.I., Friedrich T. (2013) Structural organization and dynamic processes in protein complexes determined by multiparameter imaging. SOAJ NanoPhotoBioSciences 1(1): 1-47.

Najafpour M.M., Abasi M., Allakhverdiev S.I. (2013) Recent proposed mechanisms for biological water oxidation. SOAJ NanoPhotoBioSciences 1(1): 79-92.

Mur L.A., Mandon J., Persijn S., Cristescu S.M., Moshkov I.E., Novikova G.V., Hall M.A., Harren F.J., Hebelstrup K.H., Gupta K.J. (2013) Nitric oxide in plants: an assessment of the current state of knowledge. AoB Plants 5: pls052. doi: 10.1093/aobpla/pls052

Cervený J., Sinetova M.A., Valledor L., Sherman L.A., Nedbal L. (2013) Ultradian metabolic rhythm in the diazotrophic cyanobacterium Cyanothece sp. ATCC 51142. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 32: 13210-12215. doi:10.1073/pnas.1301171110

Nath K., Phee B.K., Jeong S., Lee S.Y., Tateno Y., Allakhverdiev S.I., Lee C.H., Nam H.G. (2013) Age-dependent changes in the functions and compositions of photosynthetic complexes in the thylakoid membranes of Arabidopsis thaliana. Photosynth. Res. 117 (1-3): 547-556. doi: 10.1007/s11120-013-9906-2

Najafpour M.M., Rahimi F., Sedigh D.J., Carpentier R., Eaton-Rye J.J., Shen J.R., Allakhverdiev S.I. (2013) Gold or silver deposited on layered manganese oxide: a functional model for the water-oxidizing complex in photosystem II. Photosynth. Res. 17 (1-3): 423-429. doi: 10.1007/s11120-013-9899-x

Zivcak M., Brestic M., Balatova Z., Drevenakova P., Olsovska K., Kalaji H.M., Yang X., Allakhverdiev S.I. (2013) Photosynthetic electron transport and specific photoprotective responses in wheat leaves under drought stress. Photosynth. Res. 17 (1-3): 529-646. doi: 10.1007/s11120-013-9885-3

Kreslavski V.D., Lyubimov V.Y., Shirshikova G.N., Shmarev A.N., Kosobryukhov A.A., Schmitt F.J., Friedrich T., Allakhverdiev S.I. (2013) Preillumination of lettuce seedlings with red light enhances the resistance of photosynthetic apparatus to UV-A. J. Photochem. Photobiol. B: Biol. 122: 1-6. doi: 10.1016/j.jphotobiol.2013.02.016.

Najafpour M.M., Tabrizi M.A., Haghighi B., Eaton-Rye J.J., Carpentier R., Allakhverdiev S.I. (2013) Imidazolium or guanidinium/layered manganese (III, IV) oxide hybrid as a promising structural model for the water-oxidizing complex of Photosystem II for artificial photosynthetic systems. Photosynth. Res. 117 (1-3): 413-421. doi: 10.1007/s11120-013-9814-5

Najafpour M.M., Leonard K.C., Fan F.R., Tabrizi M.A., Bard A.J., King'ondu C.K., Suib S.L., Haghighi B., Allakhverdiev S.I. (2013) Nano-size layeredmanganese-calcium oxide as an efficient and biomimetic catalyst for water oxidation under acidic conditions: comparable to platinum. Dalton Trans. 42(14): 5085-5091. doi: 10.1039/c3dt32864c.

Kupriyanova E.V., Sinetova M.A., Cho S.M., Park Y.-I., Los D.A., Pronina N.A. (2013) CO2-concentrating mechanism in cyanobacterial photosynthesis: organization, physiological role, and evolutionary origin. Photosynth. Res. 117 (1-3): 133-146. doi: 10.1007/s11120-013-9860-z

Los D.A., Mironov K.S., Allakhverdiev S.I. (2013) Regulatory role of membrane fluidity in gene expression and physiological functions. Photosynth. Res. 116 (2-3): 489-509. doi: 10.1007/s11120-013-9823-4

Sinetova M.A., Markelova A.G. (2013)  Immunoelectron microscopy in Chlamydomonas cells. BioProtocols.

Омар С.А., Элшири Н.И., Каладжи Х.М., Эбрахим М.К.Х., Питкевич С., Ли Ч.Х., Аллахвердиев С.И. (2013) Идентификация двух кДНКкодирующих дегидриныи их дифференциальная экспрессия в процессе созревания семян Jatropha curcasБиохимия 78 (5): 637-649. 

Зорина А.А. (2013) Эукариотические протеинкиназы цианобактерий. Физиологиярастений 60(5): 625-633.

Куприянова Е.В., СинетоваМ.А., Cho S.М., Park Y.-I., МаркеловаА.Г., ЛосьД.А.ПронинаН.А. (2013) Особенности системы карбоангидраз алкалофильных цианобактерий. Физиология растений 60(4): 491-498.

Новикова Г.В., Носов А.В., Степанченко Н.С., Фоменков А.А., Мамаева А.С., Мошков И.Е. (2013) Пролиферация клеток растений и ее регуляторыФизиология растений 60(4): 529-536.

Лось Д.А. (2013) Физиология и биотехнология микроводорослей: состояние исследований и перспективы (по материалам международной конференции  «Физиология и биотехнология микроводорослей», 16-19 октября 2012 г., Москва). Физиология растений 60(4) : 459-467.

Обручева Н.В., Синькевич Н.А., Литягина С.В., Новикова Г.В. (2013) Активация кислого роста в прорастающих семенах конского каштана. Физиология растений 60(3): 452-456.


2012

Sinetova M.A.Cerveny J., Zavrel T., Nedbal L. (2012) On the dynamics and constraints of batch culture growth of the cyanobacterium Cyanothece sp. ATCC 51142. J. Biotechnol. 162(1): 148-155.

Singh-Tomar R., Mathur S., Allakhverdiev S.I., Jajoo A. (2012) Changes in PS II heterogeneity in response to osmotic and ionic stress in wheat leaves (Triticum aestivum). J. Bioenerg. Biomembr. 44: 411-419. doi: 10.1007/s10863-012-9444-1

Sinetova M.A., Kupriyanova E.V., Markelova A.G., Allakhverdiev S.I., Pronina N.A. (2012) Identification and functional role of the carbonic anhydrase Cah3 in thylakoid membranes of pyrenoid of Chlamydomonas reinhardtii. Biochim.Biophys. Acta (Bioenergetics) 1817: 1248–1255.

Mironov K.S., Sidorov R.A., Trofimova M.S., Bedbenov V.S., Tsydendambaev V.S., Allakhverdiev S.I., Los D.A. (2012) Light-dependent cold-induced fatty acid unsaturation, changes in membrane fluidity, and alterations in gene expression in SynechocystisBiochim. Biophys. Acta (Bioenergetics) 1817: 1352-1359.

Obroucheva N.V., Lityagina S.V., Novikova G.V., Sinkevich I.A. (2012) Vacuolar status and water relations in embryonic axes of recalcitrant Aesculus hippocastanum seeds during stratification and early germinationAoB Plants, pls008. doi:10.1093/aobpla/pls008 

Lysenko E.A., Pshybytko N.L., Karavaiko N.N., Yakovleva L.A., Novikova G.V., Kulaeva O.N., Kusnetsov V.V. (2012) Do plant chloroplasts contain histidine kinasesActa Physiol. Plant. 34: 1153-1164.  doi: 10.1007/s11738-011-0912-8

Omar S.A., Elsheery N.I., Kalaji H.M., Xu Z.-F., Song-Quan S., Carpentier R., Lee C.-H., Allakhverdiev S.I. (2012) Dehydroascorbate reductase and glutathionereductase play an important role in scavenging hydrogen peroxide during natural and artificial dehydration of Jatropha curcas seedsJ. Plant Biol. 55: 469-480.

Singh-Tomar R., Mathur S., Allakhverdiev S.I., Jajoo A. (2012) Changes in PS II heterogeneity in response to osmotic and ionic stress in wheat leaves (Triticum aestivum). J. Bioenerg. Biomembr. 44: 411-419.

Goltsev V., Zaharieva I., Chernev P., Kouzmanova M., Kalaji H.M., Yordanov I., Krasteva V., Alexandrov V., Stefanov D., Allakhverdiev S.I., Strasser R.J. (2012) Drought-induced modifications of photosynthetic electron transport in intact leaves: Analysis and use of neural networks as a tool for a rapid non-invasive estimation.Biochim. Biophys. Acta (Bioenergetics) 1817: 1490-1498.

Babu V.J., Kumar M.K., Nair A.S., Kheng T.L., Allakhverdiev S.I., Ramakrishna S. (2012) Visible light photocatalytic water splitting for hydrogen production from N-TiO2rice grain shaped electrospun nanostructuresIntl. J. Hydrogen Energy 37: 8897-8904.

Brestic M., Zivcak M., Kalaji H.M., Carpentier R., Allakhverdiev S.I. (2012) Photosystem II thermostability in situ: Environmentally induced acclimation and genotype-specific reactions in Triticum aestivum LPlant Physiol. Biochem. 57C: 93-105. doi: 10.1016/j.plaphy.2012.05.012

Kalaji H.M., Carpentier R., Allakhverdiev S.I., Bosa K. (2012) Fluorescence parameters as early indicators of light stress in barleyJ. Photochem. Photobiol. B. Biology 112: 1-6.

Kalaji H.M., Goltsev V., Bosa K., Allakhverdiev S.I., Strasser R.J., Govindjee. (2012) Experimental in vivo measurements of light emission in plants: A perspective dedicated to David WalkerPhotosynth. Res. 114: 69-96.

Najafpour M.M., Moghaddam A.N., Allakhverdiev S.I., Govindjee (2012) Biological water oxidation: Lessons from NatureBiochim. Biophys. Acta (Bioenergetics) 1817: 1110-1121.

Najafpour M.M., Rahimi F., Aro E.M., Lee C.H., Allakhverdiev S.I. (2012) Nano-sized manganese oxides as biomimetic catalysts for water oxidation in artificial photosynthesis: a reviewJ. Roy. Soc. Interface 9: 2383-2395.

Najafpour M.M., Moghaddam A.N., Yang Y.N., Aro E.-M., Carpentier R., Eaton-Rye J.J., Lee C.H., Allakhverdiev S.I. (2012) Biological water oxidizing complex: Anano-sized manganese-calcium oxide in a protein environmentPhotosynth. Res. 114: 1-13.

Najafpour M.M., Allakhverdiev S.I. (2012) Manganese compounds as water oxidizing catalysts for hydrogen production via water splitting: From manganese complexes to nano-sized manganese oxidesIntl. J. Hydrogen Energy 37: 8753-8764.

Murata N., Allakhverdiev S.I., Nishiyama Y. (2012) The mechanism of photoinhibition in vivo: Re-evaluation of the roles of catalase, ?-tocopherol, non-photochemical quenching, and electron transportBiochim. Biophys. Acta (Bioenergetics) 1817: 1127-1133.

Ivanov A.G., Allakhverdiev S.I., Huner N.P., Murata N. (2012) Genetic decrease in fatty acid unsaturation of phosphatidylglycerol increased photoinhibition of photosystem I at low temperature in tobacco leavesBiochim. Biophys. Acta (Bioenergetics) 1817: 1374-1379.

Allakhverdiev S.I., Huseynova I.M., Govindjee. (2012) International conference on "Photosynthesis research for sustainability-2011", July 24-30, 2011, Baku, AzerbaijanPhotosynth. Res. 110: 205-212.

Kreslavsky V.D., Fomina I.R., Los D.A., Carpentier R., Kuznetsov Vl.V., Allakhverdiev S.I. (2012) Red and near infra-red signaling: Hypothesis and perspectivesJournal of Photochemistry and Photobiology. C: Photochemistry Reviews. 13: 190-203.

Karacan M.S., Yakan C., Yakan M., Karacan N., Zharmukhamedov S.K., Shitov A., Los D.A., Klimov V.V., Allakhverdiev S.I. (2012) Quantitative structure-activity relationship analysis of perfluoroisopropyldinitrobenzene derivatives known as photosystem II electron transfer inhibitorsBiochim. Biophys. Acta(Bioenergetics) 1817(8): 1229-1236.

Sundarrajan S., Allakhverdiev S.I., Ramakrishna S. (2012) Progress and perspectives in micro direct methanol fuel cellIntl. J. Hydrogen Energy 37: 8765-8786.

Allakhverdiev S.I. (2012) Photosynthesis research for sustainability: From natural to artificialBiochim. Biophys. Acta (Bioenergetics) 1817: 1107-1109.

Allakhverdiev S.I. (2012) Photosynthetic and biomimetic hydrogen productionIntl. J. Hydrogen Energy 37: 8744-8752.

Степанченко Н.С., Фоменков А.А., Мошков И.Е., Ракитин В.Ю., Новикова Г.В., Носов А.В. (2012) Взаимодействие фитогормонов в контроле пролиферации культивируемых in vitro клеток этилен-нечувствительных мутантов Arabidopsis thaliana. Доклады АН 442(5): 714-717.

Креславский В.Д., Лось Д.А., Аллахвердиев С.И., Кузнецов Вл.В. (2012) Сигнальная роль активных форм кислорода при стрессе у растений. Физиология растений. 59: 163-178. 

Миронов К.С., Максимов Е.Г., Максимов Г.В., Бедбенов В.С., Лось Д.А. (2012) Обратная связь между текучестью мембран и транскрипцией гена desB, кодирующего ω3-десатуразу жирных кислот у цианобактерии Synechocystis. Молекулярная биология 46: 147-155.


2011

Zorina A., Stepanchenko N., Novikova G.V., Sinetova M., Panichkin V.B., Moshkov I.E., Zinchenko V.V., Shestakov S.V., Suzuki I., Murata N. Los D.A. (2011) Eukaryotic-like Ser/Thr protein kinases SpkC/F/K are involved in phosphorylation of GroES in the cyanobacterium SynechocystisDNA Research 18: 137-151. (Editor’s Choice)

Kupriyanova E.V., Sinetova M.A., Markelova A.G., Allakhverdiev S.I., Los D.A., Pronina N.A. (2011) Extracellular β-class carbonic anhydrase of the alkaliphilic cyanobacterium Microcoleus chthonoplastesJ. Photochem. Photobiol. B: Biol. 103: 78-86.

Almeida T.I.R, Calijuri M. do C., Falco P.B., Casali S.P., Kupriyanova E., Paranhos Filho A.C., Sigolo J.B., Bertolo R.A. (2011) Biogeochemical processes and the diversity of Nhecolândia lakes. Brazil. An. Acad. Bras. Cienc. 83: 391-407. doi: 10.1590/S0001-37652011000200004

Allakhverdiev S.I., Tsuchiya T., Watabe K. , Kojima A., Los D.A., Tomo T., Klimov V.V., Mimuro M. (2011) Redox potentials of primary electron acceptor quinone molecule (QA)-and conserved energetics of photosystem II of cyanobacteria with chlorophyll and d. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 108: 8054-8058.

Allakhverdiev S.I. (2011) Recent progress in the studies of structure and function of photosystem II. J. Photochem. Photobiol. B: Biol. 104: 1-8.

Tomo T., Allakhverdiev S.I., Mimuro M. (2011) Constitution and energetics of photosystem I and photosystem II in the chlorophyll d-dominated cyanobacteriumAcaryochloris marinaJ. Photochem. Photobiol. B: Biol. 104: 333-340.

Shitov A.V., Zharmukhamedov S.K., Shutova T.V., Allakhverdiev S.I., Samuelsson G., Klimov V.V. (2011) A carbonic anhydrase inhibitor induces bicarbonate-reversible suppression of electron transfer in pea photosystem 2 membrane fragmentsJ. Photochem. Photobiol. B: Biol.104: 366-371.

Nishiyama Y., Allakhverdiev S.I., Murata N. (2011) Protein synthesis is the primary target of reactive oxygen species in the photoinhibition of photosystem II.Physiol. Plantarum 142: 35-46.

Stadnichuk I.N., Bulychev A.A., Lukashev E.P., Sinetova M.A., Khristin M.S., Johnson M.P., Ruban A.V. (2011) Far-red light-regulated efficient energy transfer from phycobilisomes to photosystem I in the red microalga Galdieria sulphuraria and photosystems-related heterogeneity of phycobilisome populationBiochim. Biophys. Acta 1807: 227-235.

Mehta P., Kreslavsky V.D., Bharti S., Allakhverdiev S.I., Jajoo A. (2011) Analysis of salt stress induced changes in Photosystem II heterogeneity byprompt fluorescence and delayed fluorescence in wheat (Triticum aestivum) leavesJ. Photochem. Photobiol. B: Biol. 104: 308-313.

Mathur S., Allakhverdiev S.I., Jajoo A. (2011) Analysis of high temperature stress on the dynamics of antenna size and reducing side heterogeneity of Photosystem II in wheat leaves (Triticum aestivum)Biochim. Biophys. Acta 1807: 22–29.

Tongra T., Mehta P., Mathur S., Agrawal D., Bharti S., Los D.A., Allakhverdiev S.I., Jajoo A. (2011) Computational analysis of fluorescence induction curves in intact spinach leaves treated at different pHBioSystems 103: 158-163.

Степанченко Н.С., Новикова Г.В., Мошков И.Е. (2011) Количественное определение содержания белка. Физиология растений 58: 737-742.

Зорина А.А., Миронов К.С., Степанченко Н.С., Синетова М.А., Коробан Н.В., Зинченко В.В., Куприянова Е.В., Аллахвердиев С.И., Лось Д.А. (2011) Системы регуляции стрессовых ответов у цианобактерий. Физиология растений 58: 643-663.

Соловченко A.Е., Чивкунова О.Б., Маслова И.П. (2011) Пигментный состав, оптические свойства и устойчивость к фотодеструкции микроводоросли Haematococcus pluvialis, культивируемой при высокой освещенности. Физиология растений 58: 12-20.

Куприянова Е.В., Пронина Н.А. (2011) Карбоангидраза – фермент, преобразивший биосферу. Физиология растений 58: 162-176.

2010

Allakhverdiev S.I.Thavasi V., Kreslavski V.D., Zharmukhamedov S.K., Klimov V.V., Ramakrishna S., Los D.A.Mimuro M., Nishihara H., Carpentier R. (2010) Photosynthetic hydrogen productionJournal of Photochemistry and Photobiology, C: Photochemistry Reviews 11(2-3): 101-113.

Los D.A., Zorina A., Sinetova M.Kryazhov S., Mironov K.Zinchenko V.V. (2010) Stress sensors and signal transducers in cyanobacteriaSensors 102386-2415.

Maali-Amiri R., Yur'eva N.O, Shimshilashvili K.R., Goldenkova-Pavlova I.V., Pchelkin V.P., Kuznetsova E.V., Tsydendambaev V.D., Trunova T.I., Los D.A., Salehi Jouzani G.R., Nosov A.M. (2010) Expression of acyl-lipid Δ12-desaturase gene in prokaryotic and eukaryotic cells and its effect on cold stress tolerance. JIntegr.Plant Biol. 52: 289-297.

Аллахвердиев C.И., Жармухамедов С.К., Лось Д.А., Климов В.В.,  Мурата Н. (2010) Воздействие абиотических стрессов на цианобактерии ведет к подавлению репарации фотоповрежденной фотосистемы 2. Биохимия 75: 1621-1632.


2009

Prakash J.S.S, Sinetova M., Kupriyanova E., Zorina A., Suzuki I., Murata N., Los D.A. (2009) DNA supercoiling regulates the stress-inducible expression of genes in the cyanobacterium. Molecular BioSystems 5: 1904-1912.

Маркелова А.Г., Синетова М.П., Куприянова Е.В., Пронина Н.А. (2009) Распределение и функциональная роль карбоангидразы Cah3 в тилакоидной мембране хлоропласта и пиреноида Chlamydomonas reinhardtii. Физиология растений 56: 844-853.

Новикова Г.В., Степанченко Н.С., Носов А.В., Мошков И.Е. (2009) В начале пути: восприятие АБК и передача ее сигнала у растений. Физиология растений 56: 806-823.

Ракитин В.Ю., Прудникова О.Н., Ракитина Т.Я., Карягин В.В., Власов П.В., Новикова Г.В., Мошков И.Е. (2009) Взаимодействие этилена и АБК при регуляции уровня полиаминов у Arabidopsis thaliana во время УФ-В стресса. Физиология растений 56:163-169.

Зорина А.А., Синетова М.П., Лось Д.А. (2009) Участие серин-треониновой протеинкиназы SpkK в регуляции ответа на тепловой стресс у цианобактерии Synechocystis sp. PCC 6803. Бюллетень МОИП. Отдел биологический. Т. 114(2): 129-130.

Синетова М.П., Зорина А.А., Лось Д.А. (2009) Сверхспирализация ДНК влияет на экспрессию стресс-индуцируемых генов Synechocystis sp. PCC 6803 в условиях холодового и солевого стресса. Бюллетень МОИП. Отдел биологический. Т. 114(2): 142-144.

Миронов К.С., Лось Д.А. (2009) Влияние текучести клеточных мембран на экспрессию гена desB у Synechocystis sp. PCC 6803. Бюллетень МОИП. Отдел биологический. Т. 114(2): 141-142.

2008

Allakhverdiev S.I., Kreslavski V.D., Klimov V.V., Los D.A., Carpentier R., Mohanty P. (2008) Heat stress: an overview of molecular responses in photosynthesis.PhotosynthRes. 98: 541-550.

Зинченко В.В., Глазер В.М., Кряжов С.В., Лучкин П.В., Бабыкин М.М., Белавина Н.В., Лось Д.А. (2008) Создание коллекций мутантов для исследования генетического контроля адаптации к стрессовым факторам у Synechocystis sp. PCC 6803Экологическая генетика 6: 33-41.

Мошков И.Е., Новикова Г.В. (2008) Суперсемейство мономерных ГТФ-связывающих белков. 2. Rab-белки – регуляторы везикулярного транспорта и ответных реакций растений на стрессы. Физиология растений 55: 127-139.

Ракитин В.Ю., Прудникова О.Н., Карягин В.В., Ракитина Т.Я., Власов П.В., Борисова Т.А., Новикова Г.В., Мошков И.Е. (2008) Выделение этилена, содержание АБК и полиаминов в Arabidopsis thaliana при УФ-В стрессе. Физиология растений 55: 355-361.

Мерзляк М.Н., Чивкунова О.Б., Маслова И.П., Накви Р.К., Соловченко  А.Е., Клячко-Гурвич Г.Л. (2008) Спектры поглощения и рассеяния света клеточными суспезиями некоторых цианобактерий и микроводорослейФизиология растений 55: 464-470.

2007

Kanesaki Y., Yamamoto H., Paithoonrangsarid K., Shumskaya M., Suzuki I., Hayashi H., Murata N. (2007) Histidine kinases play important roles in the perception and signal transduction of hydrogen peroxide in the cyanobacterium Synechocystis. Plant J. 49: 313-324.

Kupriyanova E., Villarejo A., Markelova A., Gerasimenko L.,Zavarzin G., Samuelsson G., Los D.A., Pronina N. (2007) Extracellular carbonic anhydrases of the stromatolite-forming cyanobacterium Microcoleus chthonoplastes. Microbiology SGM 153: 1149-1156.

Dudoladova M.V., Kupriyanova E.V. , Markelova A.G., Sinetova M.P., Allakhverdiev S.I., Pronina N.A. (2007) The thylakoid carbonic anhydrase associated with photosystem II is the component of inorganic carbon accumulating system in cells of halo- and alkaliphilic cyanobacterium Rhabdoderma lineareBiochim. Biophys. Acta 1767: 616-623.

Allakhverdiev S.I.Los D.A., Mohanty P., Nishiyama Y., Murata N. (2007) Glycinebetaine alleviates the inhibitory effect of moderate heat stress on the repair cycle of photosystem II during photoinhibition. Biochim. Biophys. Acta (Bioenergetics) 1767: 1363-1371.

Maali R.A., Goldenkova-Pavlova I.V., Pchelkin V.P., Tsydendambaev V.D., Los D.A., Nosov A.M. (2007) Acyl-lipid Δ12-desaturase of the cyanobacterium increases the unsaturation degree in transgenic potato (Solanum tuberosum L.). Biologija 18: 36-39.

Маали Р., Шимшилашвили, Х.Р., Пчёлкин, В.П., Цыдендамбаев, В.Д., Носов А.М.,Лось Д.А., Голденкова-Павлова И.В. (2007) Сравнительное изучение экспрессии нативного и гибридного гена ацил-липидной ∆9-десатуразы в бактерии Escherichia coli. Генетика  43: 121-126.

Новикова Г.В., Мошков И.Е., Лось Д.А.(2007) Белковые сенсоры и передатчики холодового и гиперосмотического стресса у цианобактерий и растенийМолекулярная биология 41: 478-490.

Новикова Г.В., Мошков И.Е. (2007) Суперсемейство мономерных ГТФ-связывающих белков растений. 1. Роль белков Rop-семейства в регуляции роста и развития. Физиология растений 54: 932-944.

Шижнева И.А., Новикова Г.В., Обручева Н.В. (2007) Аквапорины тонопласта и плазмалеммы из осевых органов семян бобов в процессе прорастания. Доклады Академии Наук 413: 116-119.

Маали Р.А., Голденкова-Павлова И.В., Юрьева Н.А., Пчелкин В.П., Цыдендамбаев В.Д., Верещагин А.Г., Дерябин А.Н., Трунова Т.И., Лось Д.А., Носов А.М. (2007) Жирнокислотный состав липидов растений картофеля, трансформированных геном ∆12-десатуразы Synechocystis sp. PCC 6803. Физиология растений  54: 678-685.


2006

Murata N. & Los D.A. (2006) Histidine kinase Hik33 is an important participant in cold-signal transduction in cyanobacteriaPhysiol. Plant. 57: 235-247.

Panichkin V.B., Arakawa-Kobayashi S.,Kanaseki T., Suzuki I., Los D.A., Shestakov S.V., Murata N. (2006) Serine/Threonine protein kinase SpkA inSynechocystis sp. PCC 6803 is a regulator of expression of three putative pilA operons, formation of thick pili, and cell motilityJ. Bacteriol. 188: 7696-7699.

Синетова М.П., Маркелова А.Г., Лось Д.А. (2006) Влияние азотного голодания на ультраструктуру и пигментный состав хлоропластов ацидотермофильной микроводоросли Galdieria sulphuraria. Физиология растений 53: 172-181.

Попов В.Н., , Кипайкина Н.В., Меркулова Н.В., Орлова И.В., Серебрийская Т.С., Лось Д.А., Трунова Т.И., Цыдендамбаев В.Д., (2006) Участие 9-ацил-липидной десатуразы в формировании устойчивости теплолюбивых растений к гипотермии. ДАН  407: 1-4.

Егорова Е.А., Бухов Н.Г., Шугаев А.Г., Лось Д.А. (2006) Влияние экзогенной глюкозы на поток электронов к фотосистеме I и дыхание у клеток цианобактерий. Физиология растений 53: 336-342.

Селиванкина С.Ю., Зубкова Н.К., Куприянова Е.В., Люкевич Т.В., Кузнецов В.В., Лось Д.А., Кулаева О.Н. (2006) Цианобактерии реагируют на цитокинин. Физиология растений 53: 851-856.


2005

Shapiguzov A., Lyukevich A.A., Allakhverdiev S.I., Sergeyenko T.V., Suzuki I., Murata N., Los D.A. (2005) Osmotic shrinkage of cells of Synechocystis by water efflux via aquaporins regulates osmostress-inducible gene expression. Microbiology SGM 151: 447-455.

Shumskaya M.A., Paithoonrangsarid K., Kanesaki Y., Los D.A., Zinchenko V.V., Tanticharoen M., Suzuki I., Murata N. (2005) Identical Hik-Rre systems are involved in perception and transduction of salt signals and hyperosmotic signals but regulate the expression of individual genes to different extents in SynechocystisJ. Biol. Chem. 280: 21531-21538. Correction

Налимова А.В., Попова В.В., Цоглин Л.Н., Пронина Н.А. (2005) Влияние меди и цинка на рост Spirulina platensis и аккумуляция клетками тяжелых металлов. Физиология растений 52: 259-265.

Лебедева Н.В., Бойченко В.А., СеменоваЛ.Р., Пронина Н.А., Стадничук И.Н. (2005) Действие глюкозы при фотогетеротрофном росте цианобактерии Calothrix PCC 7601, способной к хроматической адаптации.Физиология растений 52: 266-273.

Лось Д.А. (2005) Молекулярные механизмы холодоустойчивости растений. Вестник РАН  № 4: 149-155.

Попов В.Н., Орлова И.В., Кипайкина Н.В., Серебрийская Т.С., Меркулова Н.В., Носов А.М., Трунова Т.И., Цыдендамбаев В.Д., Лось Д.А. (2005) Влияние трансформации табака геном Δ9-ацил-липидной десатуразы из Synechococcus vulcanus на устойчивость растений к низкой температуре. Физиология растений 52: 747-750. 


2004

Los D.A., Murata N. (2004) Membrane fluidity and its roles in the perception of environmental signalsBiochim. Biophys. Acta 1666: 142-157.

Los D.A. (2004) The effect of low-temperature-induced DNA supercoiling on the expression of the desaturase genes in SynechocystisCellMolBiol. 50: 605-612.

Marin K., Kanesaki Y., Los D.A., Murata N., Hagemann M. (2004) Gene expression profiling reflects physiological processes in salt acclimation of Synechocystis sp. strain PCC 6803Plant Physiol. 136: 3290-3300.

Paithoonrangsarid K., Shumskaya M.A., Kanesaki Y., Satoh S., Tabata S., Los D.A., Zinchenko V.V., Hayashi H., Tanticharoen M., Suzuki I., Murata N. (2004) Five histidine kinases perceive osmotic stress and regulate distinct sets of genes in Synechocystis. JBiol.Chem. 279: 53078-53086.

Kipaykina N.V., Popov V.N., Orlova I.V., Merkulova N.V., Tsydendambaev V.D., Los D.A., Trunova T.I. (2004) Cold tolerance and fatty acid composition in lipids of tobacco plants transformed by the gene  Δ9-acyl-lipid desaturase from Synechococcus vulcanus. Agriculture 2: 39-43.

Шапигузов А.Ю. (2004) Аквапорины: строение, систематика и особенности регуляции.Физиология растений 51: 1-11.

Мурадян Е.А., Клячко-Гурвич Г.Л., Цоглин Л.Н., Сергеенко Т.В., Пронина Н.А. (2004) Изменение обмена липидов при адаптации фотосинтетического аппарата Dunaliella salina к высокой концентрации СО2. Физиология растений 51: 62-72.

Лось Д.А. (2004) Низкотемпературная и субстратная индукция гена Δ9-десатуразы жирных кислот в термофильной цианобактерии Synechococcus vulcanus. Физиология растений 51: 184-189.

Маслова И.П., Мурадян Е.А., Лапина С.С., Клячко-Гурвич Г.Л., Лось Д.А. (2004) Жирнокислотный состав липидов и термофильность цианобактерий. Физиология растений 51: 396-403.

Куприянова Е.В., Маркелова А.Г., Лебедева Н.В., Герасименко Л.М., Заварзин Г.А., Пронина Н.А. (2004) α-карбоангидраза алкалофильной цианобактерии Microcoleus chthonoplastes локализована в гликокаликсе. Микробиология 73: 307-311.

Серебрийская Т.С., Лось Д.А. (2004) Функциональная характеристика гена slr1944 цианобактерии Synechocystis sp. PCC 6803. Физиология растений 51: 774-784.

Дудоладова М.В., Маркелова А.Г., Лебедева Н.В., Пронина Н.А. (2004) Компартментализация α- и β-карбоангидраз в клетках гало- и алкалофильной цианобактерии Rhabdoderma lineare. Физиология растений 51: 896-904.


2003

Sergeyenko T.V., Los D.A. (2003) Cyanobacterial leader peptides for protein secretionFEMS Microbiol. Lett. 218: 351-357.

Nazarenko L.V., Andreev I.M., Lyukevich A.A., Pisareva T.V., Los D.A. (2003) Calcium release from Synechocystis cells induced by depolarization of the plasma membrane: MscL as an outward Ca2+channel. Microbiology  UK 149: 1147-1153.

Orlova I.V., Serebriiskaya T.S., Popov V., Merkulova N., Nosov A.M., Trunova T.I., Tsydendambaev V.D., Los D.A. (2003) Transformation of tobacco with agene for the thermophilic acyl-lipid desaturase enhances the chilling tolerance of plantsPlant Cell Physiol. 44: 447-450.

Inaba M., Suzuki I., SzalontaiB.,Kanesaki Y., Los D.A., Hayashi H., MurataN. (2003) Genetically-engineered rigidification of membrane lipids enhances the cold inducibility of gene expression in SynechocystisJ. Biol. Chem. 278: 12191-12198.

Vartapetian B.B., Andreeva I.N., Generozova I.P., Polyakova L.I., Maslova I.P., Dolgikh Y.I., Stepanova A.Yu. (2003) Functional electron microscopy in studies of plant response and adaptaion to anaerobic stress. Annals of Botany 91: 1-18.

Сергеенко Т.В., Лось Д.А. (2003) Нуклеиновая кислота, кодирующая лидерную последовательность (варианты), вектор на основе плазмиды p6803-platform (варианты), лидерный пептид (варианты) и способ получения белков. Патент РФ №2209244 от 27.07.2003.

Люкевич А.А., Мурадян Е.А., Лось Д.А. (2003) Молекулярное клонирование и стресс-зависимая экспрессия гена ω-3 десатуразы жирных кислот из микроводоросли Dunaliella salina. Физиология растений 50: 541-547.

Куприянова Е.В., Лебедева Н.В., Дудоладова М.В., Герасименко Л.М.,  Алексеева С.Г., Пронина Н.А., Заварзин Г.А. (2003) Активность карбоангидраз алкалофильных цианобактерий содовых водоемов. Физиология растений 50: 598-606.


2002

Yamaguchi K., Suzuki I., Yamamoto H., Lyukevich A.A., Bodrova I., Los D.A., Piven I., Zinchenko V., Kanehisa M., Murata N. (2002) Two-component Mn2+-sensing system negatively regulates expression of the mntCAB operon in Synechocystis. Plant Cell 14: 2901-2913.

Пронина Н.А., Ковшова Ю.И., Попова В.В., Лапин А., Алексеева С.Г., Баум Р.Ф., Мишина И.М., Цоглин Л.Н. (2002) Влияние селенит-ионов на рост и накопление селена у Spirulina platensis. Физиология растений 49: 264-271.

Пронина Н.А., Аллахвердиев С.И., Куприянова Е.В., Клячко-Гурвич Г.Л., Климов В.В. (2002) Локализация карбоангидразы в субхлоропластных частицах гороха. Физиология растений 49: 341-349.

Сергеенко Т.В., Лось Д.А. (2002) Влияние стрессовых факторов на экспрессию генов, кодирующих секретируемые белки в цианобактерии Synechocystis sp. штамм PCC 6803. Физиология растений 5: 728-734.


2001

Török Z., Goloubinoff P., Horváth I., Tsvetkova N., Glatz A., Baloh G., Varvasovski V., Los D.A., Vierling E., Crowe J., Vigh L. (2001) HSP17 is an amphitropic protein that stabilizes heat-stressed membranes and binds denatured proteins for subsequent chaperone-mediated refolding. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98: 3098-3103.

Shuvalov V.A., Allakhverdiev S.I., Sakamoto A., Malakhov M.P., Murata N. (2001) Optical study of cytochrome CM formation in Synechocystis. IUBMB Life 51: 93-97.

Лось Д.А. (2001) Структура, регуляция экспрессии и функционирование десатураз жирных кислот. Успехи биологической химии 41: 163-198.

Лось Д.А. (2001) Восприятие сигналов биологическими мембранами: сенсорные белки и экспрессия генов. Соросовский образовательный журнал 7: 1-9.

 

2000

Suzuki I., Los D.A., Kanesaki Y., Mikami K., Murata N. (2000) The pathway for perception and transduction of low-temperature signals in Synechocystis. EMBO J. 19: 1327-1334.

Suzuki I.Los D.A., Murata N. (2000) Perception and transduction of low-temperature signals to induce desaturation of fatty acidsBiochem. Soc. Transact. 28, Part 6: 638-630.

Kiseleva L.L., Serebriiskaya T.S., Horvàth I.,Vigh L., Lyukevich A.A., Los D.A. (2000) Expression of the gene for the Δ9 acyl-lipid desaturase in the thermophilic cyanobacterium. J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 2: 331-338.

Sergeyenko T.V., Los D.A. (2000) Identification of secreted proteins of the cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC 6803FEMS Microbiol. Lett. 193: 213-216.

Los D.A., Murata N. (2000) Regulation of enzyme activity and gene expression by membrane fluidityScience’s Signal Transduction Knowledge Environment. http://www.stke.org/cgi/content/full/OC_sigtrans; 2000/62/pe1

Сергеенко Т.В., Мурадян Е.А., Пронина Н.А., Клячко-Гурвич Г.Л., Мишина И.М., Цоглин Л.Н. (2000) Влияние экстремально высокой концентрации СО2 на рост и биохимический состав микроводорослей. Физиология растений 47: 722-729.

Владимирова М.Г., Клячко-Гурвич Г.Л., Маслова И.П., Жолдаков И.А., Барцевич Е.Д. (2000) Комплексное изучение штамма Chlorella IPPAS-48 и пересмотр его таксономического положения. Физиология растений 47: 735-746.

Клячко-Гурвич Г.Л., Пронина Н.А., Ладыгин В.Г., Цоглин Л.Н., Семененко В.Е. (2000) Разобщенное функционирование отдельных фотосистем. 1. Особенности и роль десатурации жирных кислот. Физиология растений 47: 688-698.

Маркелова А.Г., Купцова Е.С. (2000) Пермеабилизация клеточной стенки микроводорослей: возможность применения цитоиммунохимических методов. Физиология растений 47: 811-816.

Лебедева Н.В., Семененко В.Е. (2000) Влияние 2дДг и глюкозы на гены, кодирующие белки реакционного центра фотосистемы II. Физиология растений 47: 662-667.

Пронина Н.А. (2000) СО2 концентрирующий механизм у микроводорослей. Физиология растений 47: 801-810.

Сабурова Е.А., Симонова Н.Б., Пронина Н.А., Семененко В.Е. (2000) Лактатдегидрогеназа галофильной водоросли Dunaliella salina. Физиология растений 47: 865-876.

Цоглин Л.Н., Габель Б.В. (2000) Потенциальная продуктивность микроводорослей в промышленных фотобиореакторах. Физиология растений 47: 761-767.

Лось Д.А. (2000) Влияние ингибитора ДНК-гиразы новобиоцина на экспрессию генов десатураз жирных кислот в цианобактерии Synechocystis sp. PCC 6803. Физиология растений 47: 682-687.

Маркелова А.Г., Владимирова М.Г., Купцова Е.С. (2000) Экспресс-анализ оценки жизнеспособности клеток микроводорослей.Физиология растений 47: 885-891.

Максимова И.В., Моторин, Д.Н., Плеханов С.В., Владимирова М.Г., Волгин С.А., Маслова, И.П. (2000) Оптимизация условий поддержания в коллекциях представителей микроформ красных водорослей. Физиология растений 47: 885-891.

Пирузян Э.С., Шигапова Н.В., Кобец Н.С., Голденкова И.В., Лось Д.А. (2000) Репортер для исследования активности промоторов. Патент на изобретение № 2147035 по заявке № 98112212 от 23.06.1998 г.

 

Cyanobacteria: Omics and Manipulation (Ed: Dmitry A. Los) Caister Academic Press (2017) http://www.horizonpress.com/cyano3

Photosynthesis: Structures, Mechanisms, and Applications (Eds: H. Hou, M.M. Najafpour, G. F. Moore, S.I. Allakhverdiev) Springer (2017) http://www.springer.com/us/book/9783319488714

Photosynthesis: New Approaches to the Molecular, Cellular, and Organismal Levels (Ed: S.I. Allakhverdiev) (ISBN 978-1-119-08370-2) John Wiley & Sons, Inc. Hoboken, New Jersey, and Scrivener Publishing LLC, USA. (2015) 385 pages. http://eu.wiley.com/WileyCDA/WileyTitle/productCd-1119083702.html

Лось Д.А. (2014) Десатуразы жирных кислот. М., Научный Мир, 372 стр. Оглавление [Рецензия на книгу]

Современные проблемы фотосинтеза (Contemporary problems of photosynthesis): Коллективная монография под ред. С.И. Аллахвердиева, А.Б. Рубина, В.А. Шувалова. Ижевский институт компьютерных исследований, Москва-Ижевск, т. 1, 568 стр.

Современные проблемы фотосинтеза (Contemporary problems of photosynthesis): Коллективная монография под ред. С.И. Аллахвердиева, А.Б. Рубина, В.А. Шувалова, Ижевский институт компьютерных исследований, Москва-Ижевск, т.2, 544 стр.

Current Challenger in Photosynthesis: From Natural to Artificial (2014) E-book: Hou H., Allakhverdiev S.I., Najafpour M.M., Govindjee (Eds.), Publisher: Frontiers Media SA. (ISBN: 978-2-88919-286-1). Product Name: Frontiers Research Topic E-book (2014), 102 pp.

Цоглин Л.Н., Пронина Н.А.(2012) Биотехнология микроводорослей. М., Научный Мир, 182 стр. [Рецензия на книгу на стр. 77]

Лось Д.А. (2010) Сенсорные системы цианобактерий. М., Научный Мир, 218 стр. [Рецензия на книгу] (В 2013 г. книга удостоена премии РАН им. К.А. Тимирязева).

 

Главы в книгах

Sinetova M.A., Zorina A.A., Mironov K.S., Los D.A. (2017) Transcriptomics of Cyanobacterial Stress Responses: Genes, Sensors and Molecular Triggers. In: Cyanobacteria: Omics and Manipulation. Ed. Los D.A., Caister Academic Press, Norfolk, UK. pp. 93-115.

Mironov K.S., Los D.A. (2016) Light regulation of cold stress responses in Synechocystis. In: Stress and Environmental Control of Gene Expression in Bacteria. Ed. F. J. de Bruijn. John Wiley & Sons, Inc. pp. 881-889.

Zorina A.A., Novikova G.V., Los D.A. (2016) Participation of Ser-Thr protein kinases in regulation of heat stress responses in SynechocystisIn: Stress and Environmental Control of Gene Expression in Bacteria. Ed. F. J. de Bruijn. John Wiley & Sons, Inc. pp. 766-780.

Poudyal R.S., Tiwari I., Najafpour M.M., Los D.A., Carpentier R., Shen J.-R., Allakhverdev S.I. (2016) Current Insights to Enhance Hydrogen Production by Photosynthetic Organisms. In: Hydrogen Science and Engineering: Materials, Processes, Systems and Technology (Eds: D. Stolten, B. Emonts). Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA. pp. 461-487.

Najafpour M.M., Hou H., Moore G.F., Allakhverdiev S.I. (2015) Photosynthesis: Natural Nanomachines toward Oxygen and Food Production. In: Photosynthesis: Structures, Mechanisms, and Applications (Eds: H. Hou, M.M. Najafpour, G.F. Moore, S.I. Allakhverdiev) Springer - in press.

Najafpour M.M., Salimi S., Hołyńska M., Rahimi F., Tavahodi M., Tomo T., Allakhverdiev S.I. (2015) Nanostructured Mn oxide/carboxylic acid or amine functionalized carbon nanotubes as water-oxidizing composites in artificial photosynthesis. In: Photosynthesis: Structures, Mechanisms, and Applications; (Eds: H. Hou, M.M. Najafpour, G. F. Moore, S.I. Allakhverdiev) Springer - in press.

Najafpour M.M., Balaghi S.E., Sadr M.H., Soltani B., Sedigh D.J. , Allakhverdiev S.I. (2015) Self-healing in nano-sized manganese-based water-oxidizing catalysts. In: Photosynthesis: Structures, Mechanisms, and Applications  (Eds: H. Hou, M.M. Najafpour, G. F. Moore, S.I. Allakhverdiev) Springer - in press.

Poudyal R.S., Tiwari I., Koirala A.R., Masukawa H., Inoue K., Tomo T., Najafpour M.M., Allakhverdiev S.I., Veziroglu T.N. (2015) Hydrogen production using photobiological methods. In: Compendium of Hydrogen Energy. v. I: Hydrogen Production and Purification (Eds: V. Subramani, A. Basile, T.N. Veziroglu), ISBN 978-1-78242-361-4 (print); ISBN 978-1-78242-383-6 (online), Woodhead Publishing Series in Energy No: 83. WP-Elsevier, pp. 289-317.

Najafpour M.M., Heidari S., Abasi M., Khatamian M., Allakhverdiev S.I. (2015) Layered manganese oxides as water oxidizing catalysts for hydrogen production via water splitting: An aid to environmental protection. In: CRC Concise Encyclopedia of Nanotechology (Eds: B.I. Kharisov, O.V. Kharissova, U. Ortiz-Mendez), (ISBN: 978-1466580343) CRC Press, Taylor & Francis Group, p.

Allakhverdiev S.I., Kreslavski V.D., Fomina I.R., Los D.A., Klimov V.V., Mimuro M., Mohanty P., Carpentier R. (2015) Inactivation and Repair of Photosynthetic Machinery under Heat Stress. In: Photosynthesis: Basics to Applications (Eds: S. Itoh, P. Mohanty,  K.N. Guruprasad), (ISBN 978-93-84588-54-0) Publisher: I.K. International Publishing House Pvt. Ltd. New Delhi, India, pp: 189-216.

Schmitt F.-J., Kreslavski V.D., Zharmukhamedov S.K., Friedrich T., Renger G., Los D.A., Kuznetsov V.V., Allakhverdiev S.I. (2015) The Multiple Roles of Various Reactive Oxygen Species (ROS) in Photosynthetic Organisms. In: Photosynthesis:  New Approaches to the Molecular, Cellular, and Organismal Levels (Ed: S.I. Allakhverdiev) (ISBN 978-1-119-08370-2)  John Wiley & Sons, Inc. Hoboken, New Jersey, and Scrivener Publishing LLC, USA, p: 1-84.

Kalaji H.M., Goltsev V., Brestic M., Bosa K., Allakhverdiev S.I., Strasser R.J., Govindjee (2014) In Vivo Measurements of Light Emission in Plants. In: “Contemporary problems of photosynthesis”, Allakhverdiev SI, Rubin AB, Shuvalov VA (Eds.), Institute of Computer Science, Izhevsk-Moscow. Vol. 1, p. 1- 40.

Najafpour M.M., Sedigh D.J., Eaton-Rye J.J., Allakhverdiev S.I. (2014) The Water-Oxidizing Complex in Photosystem II. In: “Contemporary problems of photosynthesis”, Allakhverdiev SI, Rubin AB, Shuvalov VA (Eds.), Institute of Computer Science, Izhevsk-Moscow. Vol. 1, p. 325-341.

Tomo T, Allakhverdiev S.I. (2014) The Divergence of Chlorophyll and Photosynthetic Reactions in Chlorophyll d-Containing Cyanobacteria. In: “Contemporary problems of photosynthesis”, Allakhverdiev SI, Rubin AB, Shuvalov VA (Eds.), Institute of Computer Science, Izhevsk-Moscow, Vol. 2, p. 115–139.

Гольцев В.Н., Каладжи Х.М., Кузманова М.А., Аллахвердиев С.И. (2014) Переменная и замедленная флуоресценция хлорофилла а – теоретические основы и практическое приложение в исследовании растений. Изд: Институт компьютерных исследований, Москва-Ижевск, 220 стр.

Креславский В.Д., Зорина А.А., Лось Д.А., Аллахвердиев С.И. (2014) Молекулярные механизмы адаптации фотосинтетического аппарата к стрессу. В книге "Фотосинтез: открытые вопросы и что мы знаем сегодня" (под ред. Аллахвердиева С.И., Рубина А.Б., Шувалова В.А.)Ижевский Институт компьютерных исследований, Ижевск–Москва, Том 2. с. 333-376.

Куприянова Е.В., Пронина Н.А. (2014) CO2-концентрирующий механизм при фотосинтезе цианобактерий: организация, физиологическая роль и эволюцияВ книге "Фотосинтез: открытые вопросы и что мы знаем сегодня" (под ред. Аллахвердиева С.И., Рубина А.Б., Шувалова В.А.), Ижевский Институт компьютерных исследований, Ижевск–Москва, Том. 2. с. 249-272.

Kreslavski V.D., Zorina A.A., Los D.A., Fomina I.R., Allakhverdiev S.I. (2013) Molecular mechanisms of stress resistance of photosynthetic machinery. In: Molecular Stress Physiology of Plants. G.R. Rout, A.B. Das (Eds.) Springer India, pp. 21-51. ISBN: 978-81-322-0806-8 (print), 978-81-322-0807-5 (on line) doi: 10.1007/978-81-322-0807-5_2

Kreslavski V.D., Fomina I.R., Los D.A.Allakhverdiev S.I. (2012) Heat induced impairments and recovery of photosynthetic machineryIn: Heat Stress: Causes, Treatment and Prevention. (Eds: Josipovic S., Ludwig E.) Nova Science Publishers, Inc. New York, pp. 89-112.

Allakhverdiev S.I., Kreslavski V.D., Fomina I.R., Los D.A., Klimov V.V., Mimuro M., Mohanty P., Carpentier R. (2012) Inactivation and repair of photosynthetic machinery under heat stress. In: Photosynthesis: Overviews on Recent Progress and Future Perspective, (Eds: Itoh S., Mohanty P., Guruprasad K.N.) I.K. International Publishing House Pvt. Ltd. New Delhi, India, pp. 189-216.

Mohanty P.,Kreslavski V.D., Los D.A., Klimov V.V., Mimuro M., Carpentier R., Allakhverdiev S.I. (2012) Heat Stress: Susceptibility, Recovery and Regulation. In:Photosynthesis. Plastid Biology, Energy Conversion and Carbon Assimilation (edited by J.J. Eaton-Rye, B.C. Tripathy, T.D. Sharkey), Springer Science + Business Media B.V. Dortrecht, The Netherlands. pp. 251-274. DOI 10.1007/978-94-007-1579-0_12

Antal T.K., Krendeleva T.E., Pashchenko V.Z., Rubin A.B., Stensjo K.,Tyystjärvi E., Los D.A., Carpentier R., Nishihara H., Allakhverdiev S.I. (2011) Photosynthetic hydrogen production: mechanisms and approaches. In: State of the Art and Progress in Production of Biohydrogen (Eds. Azbar N., Levin D.) Bentham Science Publishers, Canada, pp. 25-53.

Пронина Н.А. (2011) СО2-концентрирующие механизмы (ССМ) в эволюции биосферы. В книге "Проблемы ранней эволюции фотосинтеза" (пол ред. Горленко В.М., Рожнова С.В.) М., ПИН РАН, с. 189-216.

Мошков И.Е., Степанченко Н.С., Новикова Г.В. (2011) Количественное определение содержания белка. В книге "Молекулярно-генетические и биохимические методы в современной биологии растений" М., Бином, с. 201-211. ISBN: 978-5-9963-0738-8.

Новикова Г.В., Степанченко Н.С.,  Мошков И.Е. (2011) Разделение белков при помощи электрофореза в присутствии додецилсульфата натрия и двумерный электрофорез. В книге "Молекулярно-генетические и биохимические методы в современной биологии растений" М., Бином, с. 212-227. ISBN: 978-5-9963-0738-8.

Лось Д.А. (2011) Исследование транскрипции генов с помощью ДНК-микрочипов. В книге "Молекулярно-генетические и биохимические методы в современной биологии растений"  М., Бином, 2011, с. 167-172. ISBN: 978-5-9963-0738-8.

Kanesaki Y., Los D.A., Murata N. (2010) Sensors and signal transducers of environmental stress in cyanobacteria. In Abiotic stress Adaptation in Plants: Physiological, Molecular and Genomic Foundation (Edited by A. Pareek, S.K. Sopory, H.J. Bohnert and Govindjee), Springer, Dordrecht pp. 15-31.

Los D.A., Zinchenko V.V. (2009) Regulatory role of membrane fluidity in gene expression. In: Lipids in PhotosynthesisEssential and Regulatory Functions. H. Wada, N. Murata (eds.) Springer Science + Business Media B.V. pp. 329-348.

Allakhverdiev S.I.Los D.A., Murata N. (2009) Regulatory roles of unsaturated fatty acids in membrane lipids in photosynthesis. In: Lipids in PhotosynthesisEssential and Regulatory Functions. H. Wada, N. Murata (eds.) Springer Science + Business Media B.V. pp. 373-388.

Los D.A., Suzuki I., Zinchenko V.V., Murata N. (2008)Stress responses in Synechocystis: regulated genes and regulatory systems. In: The Cyanobacteria: Molecular Biology, Genomics and Evolution. Chapter 6, Horizon Scientific Press pp. 117– 157.

Moshkov I.E., Novikova G.V., Hall M.A., George E.F. (2008) Plant growth regulators III: gibberellins, ethylene, abscisic acid, their analogues; miscellaneous compounds. In: Plant Propagation by Tissue Culture, 3rd Edition (George E.F., Hall M.A., and De Klerk G.-J., eds.), 2008, Dordrecht: Springer, pp. 227-281.

Лось Д.А. (2007) Восприятие стрессовых сигналов биологическими мембранами. В кн. Проблемы регуляции в биологических системахБиофизические аспекты. М.-Ижевск НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», Институт компьютерных исследований. (ред. А.Б. Рубин) с. 329-360. 

Los D.A., Murata N. (2002) Sensing and responses to low temperatures in cyanobacteria. In: Sensing, Signaling and Cell Adaptation. Cell and Molecular Responses to Stress. Vol. 3. (Storey, K.B. and Storey, J.M., eds.) Elsevier Science, pp. 139-153.

Los D.A., Murata N. (2000) Responses to cold shock in cyanobacteria. In: "Cold Shock Response and Adaptation". (ed. M. Inouye). Horizon Scientific Press. WymondhamNorfolk,  UKpp. 61-83.

 
С детальным списком авторских свидетельств и патентов можно ознакомиться здесь.