Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН
 
Отдел молекулярных биосистем

Публикации IPPAS

Публикации (2000 – 2024)

2023

Yuorieva N., Sinetova M.Messineva E., Kulichenko I., Fomenkov A., Vysotskaya O., Osipova E., Baikalova A., Prudnikova O., Titova M., Nosov A.V., Popova E. (2023) Plants, cells, algae, and cyanobacteria In vitro and cryobank collections at the Institute of Plant Physiology, Russian Academy of Sciences — A platform for research and production center. Biology (Basel). 12(6),  38. https://doi.org/10.3390/biology12060838

Krivina E.S., Bobrovnikova L.A., Temraleeva A.D., Markelova A.G., Gabrielyan D.A., Sinetova M.A. (2023) Description of Neochlorella semenenkoi gen. et. sp. nov. (Chlorophyta, Trebouxiophyceae), a novel Chlorella-like alga with high biotechnological potential. Diversity 15(4), 513. https://doi.org/10.3390/d15040513

Krivina E., Sinetova M., Savchenko T., Degtyaryov E., Tebina E., Temraleeva A. (2023) Micractinium lacustre and M. thermotolerans spp. nov. (Trebouxiophyceae, Chlorophyta): Taxonomy, temperature-dependent growth, photosynthetic characteristics and fatty acid composition. Algal Research 71, 103042. https://doi.org/10.1016/j.algal.2023.103042

Gabrielyan D.A., Gabel B.V., Sinetova M.A., Gabrielian A.K., Markelova A.G., Shcherbakova N.V., Los D.A. (2023) Optimization of CO2 supply for the intensive cultivation of Chlorella sorokiniana IPPAS C-1 in the laboratory and pilot-scale flat-panel photobioreactors. Life (Basel) 12(10): 1469. doi: 10.3390/life12101469.

Gabrielyan D.A., Sinetova M.A., Gabel B.V., Gabrielian A.K., Markelova A.G., Rodionova M.V., Bedbenov V.S., Shcherbakova N.V., Los D.A. (2022) Cultivation of Chlorella sorokiniana IPPAS C-1 in flat-panel photobioreactors: from a laboratory to a pilot scale. Life (Basel). 12(9): 1309. doi: 10.3390/life12091309.

Bozieva A.M., Khasimov M.Kh., Voloshin R.A., Sinetova M.A., Kupriyanova E.V., Zharmukhamedov S.K., Dunikov D., Tsygankov A.A., Tomo T., Allakhverdiev S.I. (2023) New cyanobacterial strains for biohydrogen production. Intl. J. Hydrogen Energy 48(21): 7569-7581https://doi.org/10.1016/j.ijhydene.2022.11.198

Габриелян Д.А., Синетова М.А., Габриелян А.К., Бобровникова Л.А., Бедбенов В.С., Стариков А.Ю., Зорина А.А., Габель Б.В., Лось Д.А. (2023) Лабораторная система для интенсивного культивирования микроводорослей и цианобактерий. Физиология растений 70(2): 1–12. https://doi.org/10.31857/S0015330322600486

2022

Kupriyanova E.V., Sinetova M.A., Leusenko A.V., Voronkov A.S., Los D.A. (2022) A leader peptide of the extracellular cyanobacterial carbonic anhydrase ensures the efficient secretion of recombinant proteins in Escherichia coli. J. Biotechnol. 344: 11-23. doi: 10.1016/j.jbiotec.2021.12.006.

2021

Samylina O.S., Sinetova M.A., Kupriyanova E.V., Starikov A.Y., Sukhacheva M.V., Dziuba M.V., Tourova T.P. (2021) Ecology and biogeography of the ‘marine Geitlerinema’ cluster and a description of Sodalinema orleanskyi sp. nov., Sodalinema gerasimenkoae sp. nov., Sodalinema stali sp. nov. and Baaleninema simplex gen. et sp. nov. (Oscillatoriales, Cyanobacteria). FEMS Microbiol Ecol. 97(8): fiab104. doi: 10.1093/femsec/fiab104.

Sinetova M.A., Sidorov R.A., Medvedeva A.A., Starikov A.Y., Markelova A.G., Allakhverdiev S.I., Los D.A. (2021) Effect of salt stress on physiological parameters of microalgae Vischeria punctata strain IPPAS H-242, a superproducer of eicosapentaenoic acid. J. Biotechnol. 331: 63-73. doi: 10.1016/j.jbiotec.2021.03.001.

Бобровникова Л.А., Пахолкова М.С., Сидоров Р.А., Синетова М.А. (2021) Накопление крахмала и триацилглицеринов в клетках штамма Chlorella sp. IPPAS C-1210. Вопросы современной альгологии №2 (26): 1–7. URL: http://algology.ru/1640. https://doi.org/10.33624/2311-0147-2021-2(26)-1-7.

2020

Gaisin V.A., Grouzdev D.S., Krutkina M.S., Ashikhmin A.A., Sinetova M.A., Osipova N.S., Koziaeva V.V., Gorlenko V.M. (2020) ‘Candidatus Oscillochloris kuznetsovii‘ a novel mesophilic filamentous anoxygenic phototrophic Chloroflexales bacterium from Arctic coastal environments. FEMS Microbiol Lett. 2020 Oct 21;367(19):fnaa158. doi: 10.1093/femsle/fnaa158.

2019

Mironov K.S., Sinetova M.A., Shumskaya M., Los D.A. (2019) Universal Molecular Triggers of Stress Responses in Cyanobacterium Synechocystis. Life (Basel). 9(3): 67. doi: 10.3390/life9030067.

Gaisin V.A., Burganskaya E.I., Grouzdev D.S., Osipova N.S., Ashikhmin A.A., Sinetova M.A., Krutkina M.S., Bryantseva I.A., Sukhacheva M.V., Kochetkova T.V., Koziaeva V.V., Kalashnikov A.M., Gorlenko V.M. (2019) ‘Candidatus Oscillochloris fontis‘: a novel mesophilic phototrophic Chloroflexota bacterium belonging to the ubiquitous Oscillochloris genus. FEMS Microbiol Lett. 2019 Apr 1;366(8): fnz097. doi: 10.1093/femsle/fnz097.

Mironov K.S., Leusenko P.A., Ustinova V.V., Bolatkhan K., Zayadan B.K., Kupriyanova E.V., Shumskaya M., Sinetova M.A., Los D.A. (2019) Draft Genome Sequences of a Putative Prokaryotic Consortium (IPPAS B-1204) Consisting of a Cyanobacterium (Leptolyngbya sp.) and an Alphaproteobacterium (Porphyrobacter sp.). Microbiol Resour Announc. 8(15): e01637-18. doi: 10.1128/MRA.01637-18.

Kupriyanova E.V., Sinetova M.A., Mironov K.S., Novikova G.V., Dykman L.A., Rodionova M.V., Gabrielyan D.A., Los D.A. (2019) Highly active extracellular α-class carbonic anhydrase of Cyanothece sp. ATCC 51142. Biochimie 160: 200-209. doi: 10.1016/j.biochi.2019.03.009.

2018

Zavřel T., Chmelík D., Sinetova M.A., Červený J.J. (2018) Spectrophotometric Determination of Phycobiliprotein Content in Cyanobacterium Synechocystis. Vis. Exp. 139: 58076. doi: 10.3791/58076.

Zavřel T., Očenášová P., Sinetova M.A., Červený J. (2018) Determination of Storage (Starch/Glycogen) and Total Saccharides Content in Algae and Cyanobacteria by a Phenol-Sulfuric Acid Method. Bio Protoc. 8(15): e2966. doi: 10.21769/BioProtoc.2966.

Kupriyanova E.V., Sinetova M.A., Bedbenov V.S., Pronina N.A., Los D.A. (2018) Putative extracellular α-class carbonic anhydrase, EcaA, of Synechococcus elongatus PCC 7942 is an active enzyme: a sequel to an old storyMicrobiology (SGM) 164(4): 576-586. doi: 10.1099/mic.0.000634.

Mironov K.S., Sinetova M.A., Kupriyanova E.V., Ustinova V.V., Kozlova A.Y., Messineva E.M., Gabrielyan D.A., Bedbenov V.S., Zayadan B.K., Los D.A. (2018) Draft genome sequences of two thermotolerant cyanobacterial strains isolated from hot springsGenome Announc. 6(5):e01548-17.

Стариков А.Ю., Усербаева А.А., Миронов К.С., Сидоров Р.А., Заядан Б.К., Бедбенов В.С., Синетова М.А., Лось Д.А. (2018) Субстратная специфичность ацил-липидной Δ9-десатуразы жирных кислот из цианобактерии Cyanobacterium sp. IPPAS B-1200 с необычным жирнокислотным составом. Физиология растений  64(4): 270-278. doi: 10.7868/S0015330318040036.

Батаева Ю.В., Саткалиева М.С., Антонова С.В., Синетова М.А., Козлова А.Ю., Астафьева О.В., Баймухамбетова А.С. (2018) Исследование антиоксидантной активности и состава метаболитов цианобактерий методами ТСХ, ВЭТСХ, ВЭЖХ с целью поиска экологически безопасных агентов очистки. Экологическая химия 27(4): 175–181.

2017

Sinetova M.A., Bolakhan K., Sidorov R.A., Mironov K.S., Skrypnik A.N., Kupriyanova E.V., Zayadan B.K., Shumskaya M.A., Los D.A. (2017) Polyphasic characterization of the thermotolerant cyanobacterium Desertifilum sp. strain IPPAS B-1220FEMS Microbiol. Lett. 364(4): fnx027.

Zayadan B.K., Sadvakasova A.K., Usserbayevaa A.A., Bolatkhan K., Baizhigitova A.M., Akmukhanova N.R., Sidorov R.A., Sinetova M.A., Los D.A. (2017) Waste-free technology of wastewater treatment to obtain microalgal biomass for oil productionIntl. J. Hydrogen Energ. 42(12): 8586-8591.

Стариков А.Ю., Усербаева А.А., Лапина С.С., Миронов К.С., Маслова И.П., Пчёлкин В.П., Заядан Б.К., Синетова М.А., Лось Д.А. (2017) Субстратная специфичность ацил-липидной ∆9-десатуразы из цианобактерии Prochlorothrix hollandica – продуцента миристолеиновой кислоты. Физиология растений 64(4): 295-300.

2016

Mironov K.S., Sinetova M.A., Bolatkhan K., Zayadan B.K., Ustinova V., Kupriyanova E.V., Skrypnik A.N., Gogoleva N.E., Gogolev Y.V., Los D.A. (2016) Draft genome sequence of the thermotolerant cyanobacterium Desertifilum sp. IPPAS B-1220Genome Announc. 4(6):e01304-16. doi: 10.1128/genomeA.01304-16

Starikov A.Y., Usserbaeva A., Sinetova M.A., Sarsekeyeva F.K., Zayadan B.K., Ustinova V., Kupriyanova E.V., Los D.A., Mironov K.S. (2016) Draft genome sequence of Cyanobacterium sp. strain IPPAS B-1200 with unique fatty acid compositionGenome Announc. 4(6):e01306-16. doi: 10.1128/genomeA.01306-16

Sinetova M.A., Los D.A. (2016) Systemic analysis of transcriptomics of Synechocystis: common stress genes and their universal triggersMolecular BioSystems 12: 3254-3258.

Sinetova M.A., Los D.A. (2016) New insights in cyanobacterial cold stress responses: Genes, sensors, and molecular triggersBiochim. Biophys. Acta, General Subjects. 1860 (11, Part A): 2391–2403.

Синетова М.А., Лось Д.А. (2016) Уроки транскриптомики цианобактерий: универсальные гены и триггеры стрессовых ответов. Молекулярная биология 50(4): 685–694.

Лапина С.С., Маслова И.П., Пчёлкин В.П., Бедбенов В.С., Миронов К.С., Заядан Б.К., Усербаева А.А., Синетова M.A., Лось Д.А. (2016) Оптимизация условий культивирования цианобактерии Prochlorothrix hollandica для получения миристолеиновой кислоты. Физиология растений 63(4): 593–600.

Zorina A., Sinetova M., Kupriyanova E.V., Mironov K.S., Molkova I., Nazarenko L.V., Zinchenko V.V., Los D.A. (2016) Synechocystis mutants defective in manganese uptake regulatory system, ManSR, are hypersensitive to strong lightPhotosynth. Res. 130(1): 11-17. doi: 10.1007/s11120-015-0214-x

2015

Sinetova M.A., Mironov K.S., Mustardy L., Shapiguzov A., Bachin D., Allakhverdiev S.I., Los D.A. (2015) Aquaporin-deficient mutant of Synechocystis is sensitive to salt and high-light stressJ. Photochem. Photobiol. B. Biol. 152: 377-382. doi: 10.1016/j.jphotobiol.2015.07.012

Sarsekeyeva F., Zayadan B.K., Usserbaeva A., Bedbenov V.S., Sinetova M.A., Los D.A. (2015) Cyanofuels – biofuels from cyanobacteria: reality and perspectivesPhotosynth. Res. 125: 329-340. doi: 10.1007/s11120-015-0103-3

Červený J., Sinetova M.A., Zavřel T., Los D.A. (2015) Mechanisms of high temperature resistance of Synechocystis sp. PCC 6803: an impact of histidine kinase 34Life 5(1): 676-699. doi: 10.3390/life5010676

Zavřel T., Sinetova M.A., Búzová D., Literáková P., Červený J. (2015) Characterization of a model cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 autotrophic growth in a flat-panel photobioreactorEngineering in Life Sciences 1: 122-132. doi: 10.1002/elsc.201300165

Zavřel T., Sinetova M.A., Červený J. (2015) Measurement of chlorophyll a and carotenoid concentration in cyanobacteriaBio-protocol 5(9): e1467. http://www.bio-protocol.org/e1467

2014

Sarsekeyeva F.K., Usserbaeva A.A., Zayadan B.K., Mironov K.S., Sidorov R.A., Kozlova A. Yu., Kupriyanova E.V., Sinetova M.A., Los D.A. (2014) Isolation and characterization of a new cyanobacterial strain with a unique fatty acid compositionAdvances in Microbiology 4: 1033-1043. doi: 10.4236/aim.2014.415114

2013

Červený J., Sinetova M.A., Valledor L., Sherman L.A., Nedbal L. (2013) Ultradian metabolic rhythm in the diazotrophic cyanobacterium Cyanothece sp. ATCC 51142. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 32: 13210-13215doi:10.1073/pnas.1301171110

Kupriyanova E.V., Sinetova M.A., Cho S.M., Park Y.-I., Los D.A., Pronina N.A. (2013) CO2-concentrating mechanism in cyanobacterial photosynthesis: organization, physiological role, and evolutionary originPhotosynth. Res. 117 (1-3): 133-146 doi: 10.1007/s11120-013-9860-z

Sinetova M.A., Markelova A.G. (2013) Immunoelectron microscopy in Chlamydomonas cells. BioProtocols.

2012

Sinetova M.A., Červený J., Zavřel T., Nedbal L. (2012) On the dynamics and constraints of batch culture growth of the cyanobacterium Cyanothece sp. ATCC 51142.  J. Biotechnol. 162: 148-155.

Sinetova M.A., Kupriyanova E.V., Markelova A.G., Allakhverdiev S.I., Pronina N.A. (2012) Identification and functional role of the carbonic anhydrase Cah3 in thylakoid membranes of pyrenoid of Chlamydomonas reinhardtii. Biochim. Biophys. Acta (Bioenergetics) 1817: 1248–1255.

2011

Zorina A., Stepanchenko N., Novikova G.V., Sinetova M., Panichkin V.B., Moshkov I.E., Zinchenko V.V., Shestakov S.V., Suzuki I., Murata N., Los D.A. (2011) Eukaryotic-like Ser/Thr protein kinases SpkC/F/K are involved in phosphorylation of GroES in the cyanobacterium SynechocystisDNA Research 18: 137-151(Editor’s Choice) doi: 10.1093/dnares/dsr006

Kupriyanova E.V., Sinetova M.A., Markelova A.G., Allakhverdiev S.I., Los D.A., Pronina N.A. (2011) Extracellular β-class carbonic anhydrase of the alkaliphilic cyanobacterium Microcoleus chthonoplastesJ. Photochem. Photobiol. B: Biol. 103: 78-86.

Stadnichuk I.N., Bulychev A.A., Lukashev E.P., Sinetova M.A., Khristin M.S., Johnson M.P., Ruban A.V. (2011) Far-red light-regulated efficient energy transfer from phycobilisomes to photosystem I in the red microalga Galdieria sulphuraria and photosystems-related heterogeneity of phycobilisome populationBiochim. Biophys. Acta 1807: 227-235.

Зорина А.А., Миронов К.С., Степанченко Н.С., Синетова М.А., Коробан Н.В., Зинченко В.В., Куприянова Е.В., Аллахвердиев С.И., Лось Д.А. (2011) Системы регуляции стрессовых ответов у цианобактерийФизиология растений 58: 643-663.

СоловченкоA.Е., Чивкунова О.Б., Маслова И.П. (2011) Пигментный состав, оптические свойства и устойчивость к фотодеструкции микроводоросли Haematococcus pluvialis, культивируемой при высокой освещенностиФизиология растений 58: 12-20.

2010

Los D.A., Zorina A., Sinetova M., Kryazhov S., Mironov K., Zinchenko V.V. (2010) Stress sensors and signal transducers incyanobacteriaSensors 10:2386-2415.

2009

Prakash J.S.S., Sinetova M., Kupriyanova E., Zorina A., Suzuki I., Murata N., Los D.A. (2009) DNA supercoiling regulates the stress-inducible expression of genes in the cyanobacteriumMolecular BioSystems 5: 1904-1912.

Маркелова А.Г., Синетова М.П., Куприянова Е.В., Пронина Н.А. (2009) Распределение и функциональная ролькарбоангидразы Cah3 в тилакоидной мембране хлоропласта и пиреноида Chlamydomonas reinhardtiiФизиология растений 56: 844-853.

2008

Мерзляк М.Н., Чивкунова О.Б., Маслова И.П., Накви Р.К., Соловченко А.Е., Клячко-Гурвич Г.Л. (2008) Спектры поглощения и рассеяния света клеточными суспензиями некоторых цианобактерий и микроводорослей. Физиология растений 55: 464-470.

2007

Kupriyanova E., Villarejo A., Markelova A., Gerasimenko L.,ZavarzinG., SamuelssonG., Los D.A., Pronina N. (2007) Extracellularcarbonic anhydrases of the stromatolite-forming cyanobacterium Microcoleus chthonoplastesMicrobiology SGM 153: 1149-1156.

Dudoladova M.V., Kupriyanova E.V. , Markelova A.G., Sinetova M.A., Allakhverdiev S.I., Pronina N.A. (2007) The thylakoid carbonic anhydrase associated with photosystem II is the component of inorganic carbon accumulating system in cells of halo- and alkaliphilic cyanobacterium Rhabdoderma lineareBiochimBiophysActa 1767: 616-623.

2006

Синетова М.П., Маркелова А.Г., Лось Д.А. (2006) Влияние азотного голодания на ультраструктуру и пигментный состав хлоропластов ацидотермофильной микроводоросли Galdieria sulphurariaФизиология растений 53: 172-181.

2004

Маслова И.П., Мурадян Е.А., Лапина С.С., Клячко-Гурвич Г.Л., Лось Д.А. (2004) Жирнокислотный состав липидов и термофильность цианобактерий. Физиология растений 51: 396-403.

Куприянова Е.В., Маркелова А.Г., Лебедева Н.В., Герасименко Л.М., Заварзин Г.А., Пронина Н.А. (2004) α-карбоангидраза алкалофильной цианобактерии Microcoleus chthonoplastes локализована в гликокаликсе. Микробиология 73: 307-311.

Дудоладова М.В., Маркелова А.Г., Лебедева Н.В., Пронина Н.А. (2004) Компартментализация α- и β-карбоангидраз в клетках гало- и алкалофильной цианобактерии Rhabdoderma lineare. Физиология растений 51: 896-904.

2003

Vartapetian B.B., Andreeva I.N., Generozova I.P., Polyakova L.I., Maslova I.P., Dolgikh Y.I., Stepanova A.Yu. (2003) Functional electron microscopy in studies of plant response and adaptaion to anaerobic stress. Annals of Botany 91: 1-18.

2000

Владимирова М.Г., Клячко-Гурвич Г.Л., Маслова И.П.Жолдаков И.А., Барцевич Е.Д. (2000) Комплексное изучение штамма Chlorella IPPAS-48 и пересмотр его таксономического положения. Физиология растений 47: 735-746.

Маркелова А.Г., Купцова Е.С. (2000) Пермеабилизация клеточной стенки микроводорослей: возможность применения цитоиммунохимических методов. Физиология растений 47: 811-816.

Маркелова А.Г., Владимирова М.Г., Купцова Е.С. (2000) Экспресс-анализ оценки жизнеспособности клеток микроводорослей. Физиология растений 47: 885-891.

Максимова И.В., Моторин, Д.Н., Плеханов С.В., Владимирова М.Г., Волгин С.А., Маслова И.П. (2000) Оптимизация условий поддержания в коллекциях представителей микроформ красных водорослей. Физиология растений 47: 885-891.